RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN4-201ENST00000272638 MSRB1Q9NZV6 116 aa9.85□□□□□ -0.83
UBXN4-201ENST00000272638 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
UBXN4-201ENST00000272638 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
UBXN4-201ENST00000272638 IGLL1P15814 213 aa9.84□□□□□ -0.83
UBXN4-201ENST00000272638 MPV17L2Q567V2 206 aa9.84□□□□□ -0.83
UBXN4-201ENST00000272638 STPG4Q8N801 248 aa9.84□□□□□ -0.83
UBXN4-201ENST00000272638 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa9.84□□□□□ -0.83
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.84□□□□□ -0.83
UBXN4-201ENST00000272638 MINOS1Q5TGZ0 78 aa9.84□□□□□ -0.83
UBXN4-201ENST00000272638 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.84□□□□□ -0.83
UBXN4-201ENST00000272638 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa9.84□□□□□ -0.83
UBXN4-201ENST00000272638 FASNP49327 2511 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
UBXN4-201ENST00000272638 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa9.83□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa9.83□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 LTAP01374 205 aa9.83□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa9.83□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 FANCD2OSQ96PS1 177 aa9.83□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.83□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 PRAC2D3DTV9 90 aa9.83□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 GCSHP23434 173 aa9.83□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 LEPP41159 167 aa9.83□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 PCP4P48539 62 aa9.83□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 FOXC2Q99958 501 aa9.83□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 VPS25Q9BRG1 176 aa9.83□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.83□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.82□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa9.82□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 F6UB75 175 aa9.82□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 UBE2E1P51965 193 aa9.82□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 C8orf31Q8N9H6 132 aa9.82□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 OR11H6Q8NGC7 330 aa9.82□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 PRR25Q96S07 402 aa9.82□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 OVOL3O00110 214 aa9.82□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 CRYGCP07315 174 aa9.82□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 CTSGP08311 255 aa9.82□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 PRSS57Q6UWY2 283 aa9.82□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 MYOZ3Q8TDC0 251 aa9.82□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 A0A1W2PPR1 153 aa9.82□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.81□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 IGLC2P0DOY2 106 aa9.81□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 IGLC3P0DOY3 106 aa9.81□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 BLCAPP62952 87 aa9.81□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 DPF1Q92782 380 aa9.81□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 TSPOP30536 169 aa9.81□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF502Q8TBZ5 544 aa9.81□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 PSMB11A5LHX3 300 aa9.81□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF688P0C7X2 276 aa9.81□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa9.81□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 MOB4Q9Y3A3 225 aa9.81□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 VWC2LB2RUY7 222 aa9.8□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF124Q15973 351 aa9.8□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 Q8N9W7 124 aa9.8□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM208Q9BTX3 173 aa9.8□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa9.8□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 NPSP0C0P6 89 aa9.8□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 PAX1P15863 534 aa9.8□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 LINC00310P59036 64 aa9.8□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 TEX43Q6ZNM6 134 aa9.8□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 COX6B1P14854 86 aa9.8□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 OR4X2Q8NGF9 303 aa9.79□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 C20orf144Q9BQM9 153 aa9.79□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 HAX1O00165 279 aa9.79□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 IGHV4-39P01824 125 aa9.79□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF492Q9P255 531 aa9.79□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 NDUFA3O95167 84 aa9.79□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.79□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 RASL11AQ6T310 242 aa9.79□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 IFI27L1Q96BM0 104 aa9.79□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa9.79□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.79□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa9.78□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 NPYP01303 97 aa9.78□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 RAB9AP51151 201 aa9.78□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 FOXE3Q13461 319 aa9.78□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 Q6AWC8 147 aa9.78□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 TMEM14CQ9P0S9 112 aa9.78□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 HBDP02042 147 aa9.78□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.78□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 CFHR4Q92496 578 aa9.78□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa9.78□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 A0A1W2PRX2 142 aa9.78□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 OOSP1A8MZH6 123 aa9.78□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 SFTA2Q6UW10 78 aa9.78□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 C8orf86Q6ZUL3 223 aa9.78□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
UBXN4-201ENST00000272638 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa9.77□□□□□ -0.85
UBXN4-201ENST00000272638 FAM159AQ6UWV7 190 aa9.77□□□□□ -0.85
UBXN4-201ENST00000272638 LYPD1Q8N2G4 141 aa9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 277.5 ms