RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578348.5

GGA3-205, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-205ENST00000578348 A0A1W2PRD5 423 aa8.96□□□□□ -0.97
GGA3-205ENST00000578348 A0A1W2PRF3 423 aa8.96□□□□□ -0.97
GGA3-205ENST00000578348 A0A1W2PRM7 423 aa8.96□□□□□ -0.97
GGA3-205ENST00000578348 M0R3E3 92 aa8.96□□□□□ -0.97
GGA3-205ENST00000578348 CIDEAO60543 219 aa8.96□□□□□ -0.97
GGA3-205ENST00000578348 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
GGA3-205ENST00000578348 RIGQ13278 110 aa8.96□□□□□ -0.97
GGA3-205ENST00000578348 PSG3Q16557 428 aa8.96□□□□□ -0.97
GGA3-205ENST00000578348 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
GGA3-205ENST00000578348 ERASQ7Z444 233 aa8.96□□□□□ -0.97
GGA3-205ENST00000578348 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.96□□□□□ -0.97
GGA3-205ENST00000578348 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.96□□□□□ -0.97
GGA3-205ENST00000578348 K7ERU9 68 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 NUDT3O95989 172 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 TMEM11P17152 192 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 CRIP1P50238 77 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 PET117Q6UWS5 81 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.96□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 ITPR1Q14643 2758 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 LMO4P61968 165 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 HES1Q14469 280 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 CFAP161Q6P656 301 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 C8orf49Q96NF6 230 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 RNF24Q9Y225 148 aa8.95□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 EBI3Q14213 229 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 Q8N6K4 173 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 PIEZO1Q92508 2521 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 TMEM238C9JI98 176 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 FA2HQ7L5A8 372 aa8.94□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 GNG7O60262 68 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 CT45A10P0DMU9 189 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 UBE2E1P51965 193 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 IGHV4-39P01824 125 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 FAM106CPP0CH98 169 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 FAM106AQ4KMX7 169 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 MUC21Q5SSG8 566 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 LINC01545Q5VT33 79 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 ZNF747Q9BV97 191 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 PKD1L2Q7Z442 2459 aa8.93□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 A0A087X0K7 114 aa8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 NPIPB5A8MRT5 1133 aa8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 TAX1BP3O14907 124 aa8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 NCR2O95944 276 aa8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 CSN1S1P47710 185 aa8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 ZNF562Q6V9R5 426 aa8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 DEFB125Q8N687 156 aa8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 ARPC1AQ92747 370 aa8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 RELNP78509 3460 aa8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 A0A1B0GW15 77 aa8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 TMEM213A2RRL7 107 aa8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 D6R8Y8 96 aa8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 Q6AWC8 147 aa8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 C12orf54Q6X4T0 127 aa8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 GATD1Q8NB37 220 aa8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 LRBAP50851 2863 aa8.92□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 SNAI2O43623 268 aa8.91□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 TMEM189A5PLL7 270 aa8.91□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 OR2T8A6NH00 312 aa8.91□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 IGHV3-23P01764 117 aa8.91□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 AMN1Q8IY45 258 aa8.91□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.91□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 SH2D1AO60880 128 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 FXYD7P58549 80 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 TTC9CQ8N5M4 171 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 CCL19Q99731 98 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 PIMREGQ9BSJ6 248 aa8.9□□□□□ -0.98
GGA3-205ENST00000578348 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 337.6 ms