RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 A0A1W2PRD5 423 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-212ENST00000488380 A0A1W2PRF3 423 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-212ENST00000488380 A0A1W2PRM7 423 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-212ENST00000488380 C17orf100A8MU93 164 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-212ENST00000488380 NPIPB6E9PJ23 425 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-212ENST00000488380 ENSAO43768 121 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
NISCH-212ENST00000488380 TMEM200BQ69YZ2 307 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-212ENST00000488380 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-212ENST00000488380 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-212ENST00000488380 C16orf97H3BN30 126 aa10.68□□□□□ -0.7
NISCH-212ENST00000488380 K7EQM0 130 aa10.68□□□□□ -0.7
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NISCH-212ENST00000488380 ATP5G2Q06055 141 aa10.67□□□□□ -0.7
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NISCH-212ENST00000488380 LINC00312Q9Y6C7 94 aa10.67□□□□□ -0.7
NISCH-212ENST00000488380 NUP37Q8NFH4 326 aa10.67□□□□□ -0.7
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NISCH-212ENST00000488380 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa10.67□□□□□ -0.7
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NISCH-212ENST00000488380 HIGD1AQ9Y241 93 aa10.67□□□□□ -0.7
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NISCH-212ENST00000488380 OR4C13Q8NGP0 309 aa10.66□□□□□ -0.7
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NISCH-212ENST00000488380 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
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NISCH-212ENST00000488380 IGLV2-11P01706 119 aa10.65□□□□□ -0.71
NISCH-212ENST00000488380 RBP4P02753 201 aa10.65□□□□□ -0.71
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NISCH-212ENST00000488380 PSG8Q9UQ74 426 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-212ENST00000488380 NBASA2RRP1 2371 aa10.64□□□□□ -0.71
NISCH-212ENST00000488380 TWIST1Q15672 202 aa10.64□□□□□ -0.71
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NISCH-212ENST00000488380 LCNL1Q6ZST4 164 aa10.63□□□□□ -0.71
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NISCH-212ENST00000488380 LEPP41159 167 aa10.62□□□□□ -0.71
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NISCH-212ENST00000488380 E7EQL1 145 aa10.61□□□□□ -0.71
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NISCH-212ENST00000488380 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
NISCH-212ENST00000488380 TMEM133Q9H2Q1 129 aa10.61□□□□□ -0.71
NISCH-212ENST00000488380 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa10.61□□□□□ -0.71
NISCH-212ENST00000488380 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa10.61□□□□□ -0.71
NISCH-212ENST00000488380 NDUFB3O43676 98 aa10.61□□□□□ -0.71
NISCH-212ENST00000488380 Q6AWC8 147 aa10.61□□□□□ -0.71
NISCH-212ENST00000488380 HIST1H4GQ99525 98 aa10.61□□□□□ -0.71
NISCH-212ENST00000488380 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa10.6□□□□□ -0.71
NISCH-212ENST00000488380 AGRNO00468 2067 aa10.6□□□□□ -0.71
NISCH-212ENST00000488380 SHISA9B4DS77 424 aa10.6□□□□□ -0.71
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