RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617119.4

UBE2V1-223, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 V1, human

TSL 4 BASIC

Gene UBE2V1, Length 2,432 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2V1-223	ENST00000617119	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	DLX1	P56177	255 aa		6.98	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	FA2H	Q7L5A8	372 aa		6.98	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRGV9	Q99603	122 aa		6.98	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		6.97	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		6.97	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	6.97	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	SCGB2A2	Q13296	93 aa		6.97	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		6.97	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		6.97	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	PRNT	Q86SH4	94 aa		6.97	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		6.97	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		6.97	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		6.97	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	C17orf77	Q96MU5	243 aa		6.97	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	CRIP1	P50238	77 aa		6.97	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	DLX6	P56179	175 aa		6.97	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		6.97	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		6.97	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		6.97	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		6.97	□□□□□ -1.29
UBE2V1-223	ENST00000617119	COL8A1	P27658	744 aa		6.96	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	CSN1S1	P47710	185 aa		6.96	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	FAM27E3	Q08E93	113 aa		6.96	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		6.96	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		6.96	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		6.96	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	CRYGB	P07316	175 aa		6.96	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	RAB9A	P51151	201 aa		6.96	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		6.96	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	GATD1	Q8NB37	220 aa		6.96	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	OTOR	Q9NRC9	128 aa		6.96	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		6.96	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	SMIM13	P0DJ93	91 aa		6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	TCTA	P57738	103 aa		6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	CKS1B	P61024	79 aa		6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	LINC00311	Q8N616	119 aa		6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	SPATA25	Q9BR10	227 aa		6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119		A0A1B0GUT8	65 aa		6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	TEX22	C9J3V5	150 aa		6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	CD40	P25942	277 aa		6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	IFI27	P40305	119 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	FXYD7	P58549	80 aa		6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	LYZ	P61626	148 aa		6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	PRSS33	Q8NF86	280 aa		6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		6.95	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119		J3QR89	54 aa		6.94	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	TNFRSF1A	P19438	455 aa		6.94	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		6.94	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		6.94	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		6.94	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	VGLL1	Q99990	258 aa		6.94	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	RPL27A	P46776	148 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	PAX8	Q06710	450 aa		6.93	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	6.93	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		6.93	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		6.93	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		6.93	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		6.93	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		6.93	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		6.93	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		6.93	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	TMEM178B	H3BS89	294 aa		6.93	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	IGKV1-17	P01599	117 aa		6.93	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	ADIPOQ	Q15848	244 aa		6.93	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	C8orf49	Q96NF6	230 aa		6.93	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		6.93	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		6.92	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		6.92	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	TMEM213	A2RRL7	107 aa		6.92	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	C17orf100	A8MU93	164 aa		6.92	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119		I3L2K1	104 aa		6.92	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	CRYBA4	P53673	196 aa		6.92	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		6.92	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	PCP2	Q8IVA1	136 aa		6.92	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		6.92	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		6.92	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
UBE2V1-223	ENST00000617119		D6R8Y8	96 aa		6.92	□□□□□ -1.3

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