RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC25A22Q9H936 323 aa8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 RPRMQ9NS64 109 aa8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 FUT9Q9Y231 359 aa8.68□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 K7EMT4 169 aa8.67□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 HBE1P02100 147 aa8.67□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.67□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 C8orf88P0DMB2 117 aa8.67□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.67□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 IQCF2Q8IXL9 164 aa8.67□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 STXBP6Q8NFX7 210 aa8.67□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.67□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 UHRF2Q96PU4 802 aa8.67□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 ELOVL1Q9BW60 279 aa8.67□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 H3BRN7 92 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 OVOL1O14753 267 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 OR7C2O60412 319 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 PATE2Q6UY27 113 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 OR9G4Q8NGQ1 327 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 RAB24Q969Q5 203 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 MARC2Q969Z3 335 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF98A6NK75 572 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 A8MWP6 167 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 CXorf1O96002 111 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 CRYBB3P26998 211 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 GALR1P47211 349 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 FHITP49789 147 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 IFITM2Q01629 132 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 TM4SF20Q53R12 229 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 LCN15Q6UWW0 184 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 GPR82Q96P67 336 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.65□□□□□ -1.02
CAPNS1-209ENST00000590049 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 IL34Q6ZMJ4 242 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 Q8N1Y9 231 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 PAXXQ9BUH6 204 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 OR51M1Q9H341 326 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 SMPXQ9UHP9 88 aa8.64□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A1B0GV50 99 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM213A2RRL7 107 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 HELTA6NFD8 242 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 C2orf70A6NJV1 201 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF785A8K8V0 405 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 RGS13O14921 159 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 BUB3O43684 328 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 IFNA1P01562 189 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 CD5P06127 495 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 STAG3L2P0CL84 134 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 STAG3L3P0CL85 134 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 ARL14EPLP0DKL9 152 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 PPT1P50897 306 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 LEMD1Q68G75 181 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC25A2Q9BXI2 301 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 HRH4Q9H3N8 390 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.63□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 CHEK1O14757 476 aa8.62□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 FOLR2P14207 255 aa8.62□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 CBLN1P23435 193 aa8.62□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 PSMB3P49720 205 aa8.62□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF726P1Q15940 193 aa8.62□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.62□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa8.62□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.62□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 TMEM14CQ9P0S9 112 aa8.62□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.62□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 EPM2AB3EWF7 344 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 RTL8CO15255 209 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 SAP30O75446 220 aa8.61□□□□□ -1.03
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