RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 PPP1R1AQ13522 171 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 S100A7AQ86SG5 101 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 OR10J6PQ8NGY7 276 aa11.82□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 A0A087X0K7 114 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 A0A0J9YY99 117 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 H7BYZ3 331 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 PLP1P60201 277 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 SELENOTP62341 195 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 TTC32Q5I0X7 151 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
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CS-214ENST00000548849 PSENENQ9NZ42 101 aa11.81□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 ADAP1O75689 374 aa11.8□□□□□ -0.52
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CS-214ENST00000548849 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP11.8□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 PYDC2Q56P42 97 aa11.8□□□□□ -0.52
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CS-214ENST00000548849 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
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CS-214ENST00000548849 PMS2P5A8MQ11 134 aa11.79□□□□□ -0.52
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CS-214ENST00000548849 RXFP4Q8TDU9 374 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 TRIM63Q969Q1 353 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 ARV1Q9H2C2 271 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 Q9H3A6 140 aa11.79□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 GAGE12BA1L429 117 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 GAGE7O76087 117 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 GAGE12FP0CL80 117 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 GAGE12GP0CL81 117 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 GAGE12IP0CL82 117 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 KRTAP10-2P60368 255 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 KIR3DS1Q14943 382 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 ESRGQ1W209 222 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 ZNF503Q96F45 646 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 BCL7BQ9BQE9 202 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 C20orf144Q9BQM9 153 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 NPVFQ9HCQ7 196 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 RNF24Q9Y225 148 aa11.78□□□□□ -0.52
CS-214ENST00000548849 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 SSSCA1O60232 199 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 NOL3O60936 208 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 CCNKO75909 580 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 RLN2P04090 185 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 CXCL2P19875 107 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 HOXA5P20719 270 aa11.77□□□□□ -0.53
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CS-214ENST00000548849 UPK3BQ9BT76 320 aa11.77□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 A0A1W2PPQ1 181 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 SNURFLB1AK76 121 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 J3KRW8 73 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 METTL15P1P0C7V9 234 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 BTF3P20290 206 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 SLC38A11Q08AI6 406 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 TEPPQ6URK8 271 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 LCN15Q6UWW0 184 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 LINC00305Q7Z4B0 112 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 LINC00612Q8N6U2 182 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 SMIM8Q96KF7 97 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 MGAT4CQ9UBM8 478 aa11.76□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 GFI1BQ5VTD9 330 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 OR10P1Q8NGE3 313 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 ZNF586Q9NXT0 402 aa11.75□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 C9orf170A2RU37 121 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 PRAC2D3DTV9 90 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 H3BMQ9 156 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 H3BTX0 84 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 GOSR2O14653 212 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 PXDC1Q5TGL8 231 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa11.74□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa11.74□□□□□ -0.53
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CS-214ENST00000548849 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 SLC17A3O00476 420 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 ZNF546Q86UE3 836 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa11.72□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 AGPAT2O15120 278 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 COX7A2P2O60397 106 aa11.71□□□□□ -0.53
CS-214ENST00000548849 LEPP41159 167 aa11.71□□□□□ -0.53
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