RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511		Q9H521	79 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511		A8MTW9	85 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM25A	B3EWG3	89 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM25C	B3EWG5	89 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM25G	B3EWG6	89 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	APOA1	P02647	267 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	S100A7	P31151	101 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF182	Q8N6D2	247 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	NAA60	Q9H7X0	242 aa		7.46	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	GAGE7	O76087	117 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	RLN2	P04090	185 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	GAGE12F	P0CL80	117 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	GAGE12G	P0CL81	117 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	GAGE12I	P0CL82	117 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	ORM2	P19652	201 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	TBP	P20226	339 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	C17orf77	Q96MU5	243 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR82	Q96P67	336 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		7.45	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A087WWL8	130 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF98	A6NK75	572 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	HPGDS	O60760	199 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB3D	O95716	219 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	7.44	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB11A	P62491	216 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB32	Q13637	225 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	OR52I2	Q8NH67	350 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	TRGV9	Q99603	122 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	RBKS	Q9H477	322 aa		7.44	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	SNURFL	B1AK76	121 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511		H7BYZ3	331 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	SIVA1	O15304	175 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	SCGB1D2	O95969	90 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS2R19	P59542	299 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP10-1	P60331	282 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR107	Q5VW38	600 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	OR1S1	Q8NH92	325 aa		7.43	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	CDKN1B	P46527	198 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	CCR6	P51684	374 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	SMCO1	Q147U7	214 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	NFE4	Q86UQ8	179 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	7.42	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		7.42	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	DISC1	C4P0D8	188 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BNG1	76 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	IAPP	P10997	89 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	AKR1C4	P17516	323 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	HAMP	P81172	84 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	MZT2A	Q6P582	158 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		7.41	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A087WTM6	91 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	NXPH4	O95158	308 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	AKR1C1	Q04828	323 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC190	Q86UF4	302 aa		7.4	□□□□□ -1.22

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