RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 CXCL1P09341 107 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 C15orf65H3BRN8 121 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 GZMBP10144 247 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 MLANAQ16655 118 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 SYNJ2BPP57105 145 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 C1orf194Q5T5A4 169 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 NBASA2RRP1 2371 aa13.73□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 IGKCP01834 107 aa13.72□□□□□ -0.21
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NISCH-213ENST00000489895 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 CR1LQ2VPA4 569 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 HELZP42694 1942 aaKnown RBP13.72□□□□□ -0.21
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NISCH-213ENST00000489895 C3orf56Q8N813 242 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 ZNRD1Q9P1U0 126 aa13.72□□□□□ -0.21
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NISCH-213ENST00000489895 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 A0A087WX48 190 aa13.72□□□□□ -0.21
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NISCH-213ENST00000489895 VGLL1Q99990 258 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 GFRA4Q9GZZ7 299 aa13.72□□□□□ -0.21
NISCH-213ENST00000489895 LINC01619G3V211 115 aa13.71□□□□□ -0.21
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NISCH-213ENST00000489895 D6R8Y8 96 aa13.71□□□□□ -0.21
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NISCH-213ENST00000489895 HIST3H2BBQ8N257 126 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-213ENST00000489895 NDUFAF3Q9BU61 184 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-213ENST00000489895 USF3Q68DE3 2245 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-213ENST00000489895 SEC11AP67812 179 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-213ENST00000489895 HEATR5AQ86XA9 2040 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-213ENST00000489895 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
NISCH-213ENST00000489895 PLNP26678 52 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-213ENST00000489895 GFI1BQ5VTD9 330 aa13.7□□□□□ -0.22
NISCH-213ENST00000489895 Q8NFD4 153 aa13.7□□□□□ -0.22
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NISCH-213ENST00000489895 WT1P19544 449 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-213ENST00000489895 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
NISCH-213ENST00000489895 TMEM75Q8N9X5 138 aa13.69□□□□□ -0.22
NISCH-213ENST00000489895 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
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NISCH-213ENST00000489895 SLC25A20O43772 301 aa13.67□□□□□ -0.22
NISCH-213ENST00000489895 POU2AF1Q16633 256 aa13.67□□□□□ -0.22
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NISCH-213ENST00000489895 A0A1B0GV90 55 aa13.66□□□□□ -0.22
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NISCH-213ENST00000489895 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-213ENST00000489895 G3V318 75 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-213ENST00000489895 TMEM249Q2WGJ8 235 aa13.66□□□□□ -0.22
NISCH-213ENST00000489895 ZNF815PA8K554 130 aa13.66□□□□□ -0.22
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NISCH-213ENST00000489895 DEFB121Q5J5C9 76 aa13.66□□□□□ -0.22
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NISCH-213ENST00000489895 TEX43Q6ZNM6 134 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-213ENST00000489895 IL17RELQ6ZVW7 336 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-213ENST00000489895 UBE2E2Q96LR5 201 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-213ENST00000489895 LIME1Q9H400 295 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-213ENST00000489895 TRBV19A0A075B6N1 114 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-213ENST00000489895 IGHV2-5P01817 119 aa13.65□□□□□ -0.22
NISCH-213ENST00000489895 PCNX2A6NKB5 2137 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 A0A1B0GWB2 263 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 PLEKHB2Q96CS7 222 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 TMEM14CQ9P0S9 112 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 ZNF134P52741 427 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 RHODO00212 210 aa13.64□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
NISCH-213ENST00000489895 HSD52Q0P140 79 aa13.63□□□□□ -0.23
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