RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 WRBO00258 174 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 CLN5O75503 358 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A6P12236 298 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 TPT1P13693 172 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 RPL12P30050 165 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 DEFB1P60022 68 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 VAMP2P63027 116 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 LGALS9BQ3B8N2 356 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 BSXQ3C1V8 233 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM41BQ5BJD5 291 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 PSMG4Q5JS54 123 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 C16orf54Q6UWD8 224 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 Q6ZRM9 215 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 OR4X1Q8NH49 305 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 OR1S1Q8NH92 325 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 LRRC20Q8TCA0 184 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 GLMPQ8WWB7 406 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 AQP10Q96PS8 301 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 METTL26Q96S19 204 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A31Q9H0C2 315 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM231Q9H6L2 316 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 XCL2Q9UBD3 114 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.66□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa4.65□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PS18 150 aa4.65□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 RNF222A6NCQ9 220 aa4.65□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 H3BMM0 161 aa4.65□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 NXPH3O95157 252 aa4.65□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 MBPP02686 304 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 NMBP08949 121 aa4.65□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 P0DMU3 169 aa4.65□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 FAM231AP0DMU4 169 aa4.65□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 FAM231CP0DMU5 169 aa4.65□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 AKR1C2P52895 323 aa4.65□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 GDF5OSQ5U4N7 250 aa4.65□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 NDUFAF3Q9BU61 184 aa4.65□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 OR5AC2Q9NZP5 309 aa4.65□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 HELTA6NFD8 242 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 FAM90A26D6RGX4 464 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 H0YIZ8 118 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 IFNA17P01571 189 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 IGLC1P0CG04 106 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 SNCAP37840 140 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 OPRK1P41145 380 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 FXYD7P58549 80 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 TOR2AQ5JU69 321 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 ALKAL2Q6UX46 152 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 FAM219AQ8IW50 185 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 BAP18Q8IXM2 172 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 OR4D5Q8NGN0 318 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 STOML3Q8TAV4 291 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM170AQ8WVE7 144 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 CACFD1Q9UGQ2 172 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 NACAE9PAV3 2078 aa4.64□□□□□ -1.67
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HOXD8-202ENST00000429017 CORTO00230 105 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 MED6O75586 246 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 EMP1P54849 157 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 NMSQ5H8A3 153 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 COMMD7Q86VX2 200 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 LHFPL5Q8TAF8 219 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 NEU1Q99519 415 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 CYTL1Q9NRR1 136 aa4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 KRBOX1C9JBD0 128 aa4.63□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 BUB3O43684 328 aa4.63□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 SSSCA1O60232 199 aa4.63□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 IFNA10P01566 189 aa4.63□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 IGKV3-20P01619 116 aa4.63□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 HLA-DRB4P13762 266 aa4.63□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 M6PRP20645 277 aa4.63□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 CAV2P51636 162 aa4.63□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 RND2P52198 227 aa4.63□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP4.63□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 AARDQ4LEZ3 155 aa4.63□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 STX12Q86Y82 276 aa4.63□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 OR1S2Q8NGQ3 325 aa4.63□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 GPR146Q96CH1 333 aa4.63□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 DKK2Q9UBU2 259 aa4.63□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa4.63□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.62□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa4.62□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 IL4P05112 153 aa4.62□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 SPART-AS1P0CW21 52 aa4.62□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 NPY1RP25929 384 aa4.62□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 OR10J1P30954 320 aa4.62□□□□□ -1.67
HOXD8-202ENST00000429017 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP4.62□□□□□ -1.67
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