RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367576.5

LTV1-201, Transcript of LTV1 ribosome biogenesis factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTV1, Length 1,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1-201ENST00000367576 RPH3ALQ9UNE2 315 aa13.5□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP13.5□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 SCO2A0A1W2PP80 73 aa13.5□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 A0A1W2PRE2 83 aa13.5□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 A0A1W2PS18 150 aa13.5□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 TMEM218A2RU14 115 aa13.5□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 ELOVL1Q9BW60 279 aa13.5□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 SLC35B3Q9H1N7 401 aa13.5□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 ADCYAP1P18509 176 aa13.49□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 RPL11P62913 178 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 GNG5P63218 68 aa13.49□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 IGFL4Q6B9Z1 124 aa13.49□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 OR9G4Q8NGQ1 327 aa13.49□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 GPR82Q96P67 336 aa13.49□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 PGPA6NDG6 321 aa13.48□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 FOLR2P14207 255 aa13.48□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 CBLN1P23435 193 aa13.48□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa13.48□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa13.48□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa13.48□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 F8W036 122 aa13.48□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 ZNF674Q2M3X9 581 aa13.48□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 TCF24Q7RTU0 167 aa13.48□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 HLA-DMBP28068 263 aa13.47□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 PEMTQ9UBM1 199 aa13.47□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 MLXQ9UH92 298 aa13.47□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 A0A087X0K7 114 aa13.46□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 MYCNOSP40205 109 aa13.46□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 CCDC28AQ8IWP9 274 aa13.46□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 DERL1Q9BUN8 251 aa13.46□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 SMDT1Q9H4I9 107 aa13.46□□□□□ -0.25
LTV1-201ENST00000367576 F6UZH7 168 aa13.46□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 M0QZ24 198 aa13.46□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 OVOL1O14753 267 aa13.46□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 PDE6DO43924 150 aa13.46□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 BMI1P35226 326 aa13.46□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 FAM90A2PQ658T7 463 aa13.46□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 GBGT1Q8N5D6 347 aa13.46□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 RNF182Q8N6D2 247 aa13.46□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 CITED1Q99966 193 aa13.46□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 OTORQ9NRC9 128 aa13.46□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 M0R3E3 92 aa13.45□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 CSN3P07498 182 aa13.45□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 SOHLH1Q5JUK2 328 aa13.45□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 TXNDC17Q9BRA2 123 aa13.45□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 HELTA6NFD8 242 aa13.44□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 KRBOX1C9JBD0 128 aa13.44□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 PF4P02776 101 aa13.44□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 TFPI2P48307 235 aa13.44□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 PDE6HQ13956 83 aa13.44□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 PARLQ9H300 379 aa13.44□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 AAMDCQ9H7C9 122 aa13.44□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 TMEM250H0YL14 139 aa13.43□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 S100A1P23297 94 aa13.43□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 WFDC3Q8IUB2 231 aa13.43□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 DYNLRB2Q8TF09 96 aa13.43□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 PEX7O00628 323 aa13.43□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 APOC3P02656 99 aa13.43□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 PSG9Q00887 426 aa13.43□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 C5orf17Q8NAS9 161 aa13.43□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 CMTM2Q8TAZ6 248 aa13.43□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 NRN1Q9NPD7 142 aa13.43□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 EPDR1Q9UM22 224 aa13.43□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa13.42□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 GUCA2BQ16661 112 aa13.42□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 C11orf52Q96A22 123 aa13.42□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 C16orf92Q96LL3 132 aa13.42□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 LINC00479Q96M42 142 aa13.42□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 SMIM7Q9BQ49 75 aa13.42□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 TRAV34A0A0B4J273 112 aa13.41□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 ZNF727A8MUV8 499 aa13.41□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 AKR1C3P42330 323 aa13.41□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 LYPD1Q8N2G4 141 aa13.41□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 SGK494Q96LW2 274 aa13.41□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 SLC50A1Q9BRV3 221 aa13.41□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 SEC11CQ9BY50 192 aa13.41□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 ZNF253O75346 499 aa13.41□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa13.41□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 C2CD4CQ8TF44 421 aa13.41□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 TCRAP04437 139 aa13.4□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 C20orf173Q96LM9 149 aa13.4□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 MS4A6AQ9H2W1 248 aa13.4□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
LTV1-201ENST00000367576 SOCS3O14543 225 aa13.39□□□□□ -0.27
LTV1-201ENST00000367576 RPL35P42766 123 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
LTV1-201ENST00000367576 MEOX2P50222 304 aa13.39□□□□□ -0.27
LTV1-201ENST00000367576 C10orf91Q5T1B1 145 aa13.39□□□□□ -0.27
LTV1-201ENST00000367576 ATG101Q9BSB4 218 aa13.39□□□□□ -0.27
LTV1-201ENST00000367576 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
LTV1-201ENST00000367576 PGPEP1LA6NFU8 196 aa13.39□□□□□ -0.27
LTV1-201ENST00000367576 SAP30O75446 220 aa13.39□□□□□ -0.27
LTV1-201ENST00000367576 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
LTV1-201ENST00000367576 CNN1P51911 297 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
LTV1-201ENST00000367576 TMEM61Q8N0U2 210 aa13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.8 ms