RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 IGHV3-11P01762 117 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 ARL3P36405 182 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 RELQ04864 619 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 PRR27Q6MZM9 219 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 MLST8Q9BVC4 326 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 M0R3E3 92 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 UBE2CO00762 179 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 IGLV1-40P01703 118 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 APOHP02749 345 aaPredicted RBP13.8□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 AKR1D1P51857 326 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 CFHR3Q02985 330 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 PDE6HQ13956 83 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 NUDT10Q8NFP7 164 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 OR5R1Q8NH85 324 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 NUDT11Q96G61 164 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 ATP6V0BQ99437 205 aa13.8□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa13.79□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 BUB3O43684 328 aa13.79□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 S100A7P31151 101 aa13.79□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 Q71RC1 249 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 PRNTQ86SH4 94 aa13.79□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 USMG5Q96IX5 58 aa13.79□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 DIRC3C9JPN6 131 aa13.78□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 CA1P00915 261 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 TCL1AP56279 114 aa13.78□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 ACTL10Q5JWF8 245 aa13.78□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 FAM231DQ6ZW35 169 aa13.78□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 Q86TA4 180 aa13.78□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 BTF3L4Q96K17 158 aa13.78□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 AAMDCQ9H7C9 122 aa13.78□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 GATCO43716 136 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 PSG9Q00887 426 aa13.78□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 IGFL4Q6B9Z1 124 aa13.78□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 ASCL2Q99929 193 aa13.78□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 VPREB3Q9UKI3 123 aa13.78□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 TEX15Q9BXT5 2789 aa13.78□□□□□ -0.2
ACTB-201ENST00000331789 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa13.77□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa13.77□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 RAB9AP51151 201 aa13.77□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 SMIM12Q96EX1 92 aa13.77□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 METTL26Q96S19 204 aa13.77□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 ZNF785A8K8V0 405 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 OR4X2Q8NGF9 303 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 CREBBPQ92793 2442 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 SPINK4O60575 86 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 HLA-DMBP28068 263 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 C10orf99Q6UWK7 81 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 IL17RELQ6ZVW7 336 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 TMEM75Q8N9X5 138 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 TMEM190Q8WZ59 177 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 ZNF580Q9UK33 172 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 U3KQE9 123 aa13.76□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 HOXA5P20719 270 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 SLC35B1P78383 322 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 PSG3Q16557 428 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 TMEM183AQ8IXX5 376 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 GRAMD2BQ96HH9 432 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 PSG8Q9UQ74 426 aa13.75□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 ITPR3Q14573 2671 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 A0A0G2JLM5 398 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 K7EQM0 130 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 IGHG4P01861 327 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 CSN1S1P47710 185 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 GFI1BQ5VTD9 330 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 PRDM13Q9H4Q3 707 aa13.74□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 A0A087X0K7 114 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 C19orf71A6NCJ1 209 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 CBLN1P23435 193 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 C1orf194Q5T5A4 169 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 ZNF492Q9P255 531 aa13.73□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 NDUFA4O00483 81 aa13.72□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 ZNF253O75346 499 aa13.72□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa13.72□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 DUX5Q96PT3 197 aa13.72□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 PRSS22Q9GZN4 317 aa13.72□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 PDZD2O15018 2839 aa13.72□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 CHEK1O14757 476 aa13.72□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 PSMB8P28062 276 aa13.72□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa13.72□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 ZNF702PQ9H963 129 aa13.72□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 IZUMO1RA6ND01 250 aa13.71□□□□□ -0.21
ACTB-201ENST00000331789 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.8 ms