RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 ZNF785A8K8V0 405 aa15.05■□□□□ -0
USP21-201ENST00000289865 DIRC3C9JPN6 131 aa15.05■□□□□ -0
USP21-201ENST00000289865 PSG3Q16557 428 aa15.05■□□□□ -0
USP21-201ENST00000289865 Q8N976 141 aa15.05■□□□□ -0
USP21-201ENST00000289865 PAM16Q9Y3D7 125 aa15.05■□□□□ -0
USP21-201ENST00000289865 SAA4P35542 130 aa15.04■□□□□ -0
USP21-201ENST00000289865 ZFP30Q9Y2G7 519 aa15.04■□□□□ -0
USP21-201ENST00000289865 ITPR1Q14643 2758 aa15.04■□□□□ -0
USP21-201ENST00000289865 A0A1B0GV90 55 aa15.04■□□□□ -0
USP21-201ENST00000289865 FAM231BA6NCW3 169 aa15.04■□□□□ -0
USP21-201ENST00000289865 PDE6HQ13956 83 aa15.04■□□□□ -0
USP21-201ENST00000289865 C16orf54Q6UWD8 224 aa15.04■□□□□ -0
USP21-201ENST00000289865 VAMP8Q9BV40 100 aa15.04■□□□□ -0
USP21-201ENST00000289865 AAMDCQ9H7C9 122 aa15.04■□□□□ -0
USP21-201ENST00000289865 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
USP21-201ENST00000289865 LPAR2Q9HBW0 351 aa15.03■□□□□ -0
USP21-201ENST00000289865 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
USP21-201ENST00000289865 SCGB2A1O75556 95 aa15.02■□□□□ -0
USP21-201ENST00000289865 CTSGP08311 255 aa15.02■□□□□ -0
USP21-201ENST00000289865 ECSCRQ19T08 205 aa15.02■□□□□ -0
USP21-201ENST00000289865 TMUB1Q9BVT8 246 aa15.02■□□□□ -0
USP21-201ENST00000289865 EREGO14944 169 aa15.02□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 HSBP1O75506 76 aa15.02□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 C3orf79P0CE67 100 aa15.02□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa15.02□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 BORCS7Q96B45 105 aa15.01□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 C20orf144Q9BQM9 153 aa15.01□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 C2orf88Q9BSF0 95 aa15.01□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 CHEK1O14757 476 aa15.01□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 ATP6V0E1O15342 81 aa15.01□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 RABAC1Q9UI14 185 aa15.01□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa15□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa15□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 RPL7P18124 248 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 C8orf49Q96NF6 230 aa15□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 TXN2Q99757 166 aa15□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 M0R2Z0 102 aa15□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 NPFFO15130 113 aa15□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 CSN1S1P47710 185 aa15□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 C15orf32Q32M92 178 aa15□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 CACNA1BQ00975 2339 aa14.99□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 HAX1O00165 279 aa14.99□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 APOHP02749 345 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 CRIP1P50238 77 aa14.99□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 PSG9Q00887 426 aa14.99□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 LINC00469Q8N7U9 141 aa14.99□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 OVOL3O00110 214 aa14.98□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 IGHV4-39P01824 125 aa14.98□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 GPR183P32249 361 aa14.98□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 RHOGP84095 191 aa14.98□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa14.98□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 SNHG12Q9BXW3 62 aa14.98□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 M0QZ24 198 aa14.97□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 ZNF502Q8TBZ5 544 aa14.97□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 MIEN1Q9BRT3 115 aa14.97□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa14.97□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa14.97□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 A0A1B0GUT8 65 aa14.97□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 FAM181BA6NEQ2 426 aa14.97□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 ARMS2P0C7Q2 107 aa14.97□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 CT45A10P0DMU9 189 aa14.97□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa14.96□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 LINC01548A6NM66 108 aa14.96□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 G3V318 75 aa14.96□□□□□ -0.01
USP21-201ENST00000289865 IGFL4Q6B9Z1 124 aa14.95□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa14.95□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 M0R143 59 aa14.95□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 CLEC3BP05452 202 aa14.95□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 TPPP3Q9BW30 176 aa14.95□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 ABCA2Q9BZC7 2435 aa14.95□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 RIGQ13278 110 aa14.94□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 SPATA45Q537H7 98 aa14.94□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 FAM162BQ5T6X4 162 aa14.94□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 EBLN2Q6P2I7 272 aa14.94□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 RAB4AP20338 218 aa14.94□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 HLA-DMBP28068 263 aa14.94□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 PMCHL1Q16048 86 aa14.94□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 LCN12Q6JVE5 192 aa14.94□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 NDFIP1Q9BT67 221 aa14.94□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 PKD1L2Q7Z442 2459 aa14.93□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 RELQ04864 619 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 KLK9Q2XQG4 91 aa14.93□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 TMEM219Q86XT9 240 aa14.93□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 C5orf56Q8N8D9 126 aa14.93□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 ZFAND3Q9H8U3 227 aa14.93□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 KLK9Q9UKQ9 250 aa14.93□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 SH2D1AO60880 128 aa14.92□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 RNF224P0DH78 156 aa14.92□□□□□ -0.02
USP21-201ENST00000289865 S100A7P31151 101 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.4 ms