RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261917.3

HCN4-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN4, Length 7,228 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4-201ENST00000261917 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa14.66□□□□□ -0.06
HCN4-201ENST00000261917 WDR81Q562E7 1941 aa14.66□□□□□ -0.06
HCN4-201ENST00000261917 BTCP35070 178 aa14.66□□□□□ -0.06
HCN4-201ENST00000261917 PFN2P35080 140 aa14.65□□□□□ -0.06
HCN4-201ENST00000261917 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HCN4-201ENST00000261917 CACNA1EQ15878 2313 aa14.65□□□□□ -0.06
HCN4-201ENST00000261917 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HCN4-201ENST00000261917 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.65□□□□□ -0.06
HCN4-201ENST00000261917 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa14.65□□□□□ -0.06
HCN4-201ENST00000261917 LEPROTO15243 131 aa14.65□□□□□ -0.06
HCN4-201ENST00000261917 GAGE6Q13070 117 aa14.65□□□□□ -0.06
HCN4-201ENST00000261917 C5orf30Q96GV9 206 aa14.65□□□□□ -0.06
HCN4-201ENST00000261917 MS4A6AQ9H2W1 248 aa14.65□□□□□ -0.06
HCN4-201ENST00000261917 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HCN4-201ENST00000261917 FAM120AOSQ5T036 256 aa14.65□□□□□ -0.06
HCN4-201ENST00000261917 Q6P435 159 aa14.65□□□□□ -0.06
HCN4-201ENST00000261917 TMEM170AQ8WVE7 144 aa14.65□□□□□ -0.06
HCN4-201ENST00000261917 TMEM158Q8WZ71 300 aa14.65□□□□□ -0.06
HCN4-201ENST00000261917 GNB1LQ9BYB4 327 aa14.64□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 TSC2P49815 1807 aa14.64□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 TNFSF13O75888 250 aa14.64□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 EREGO14944 169 aa14.64□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 CEP250Q9BV73 2442 aa14.64□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 LINC00518Q8N0U6 118 aa14.64□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 NUP35Q8NFH5 326 aa14.64□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa14.64□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 E9PQ18 207 aa14.63□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 PPBPP02775 128 aa14.63□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 GLRX5Q86SX6 157 aa14.63□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 ORAOV1Q8WV07 137 aa14.63□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 VCYO14598 125 aa14.63□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 CADP27708 2225 aa14.63□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 A0A087WWC5 75 aa14.63□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa14.63□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.63□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 IGHV1-69P01742 117 aa14.63□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 GAS1P54826 345 aa14.63□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 LINC00479Q96M42 142 aa14.63□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.63□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 C9orf139Q6ZV77 190 aa14.63□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 PRIMA1Q86XR5 153 aa14.63□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 AMN1Q8IY45 258 aa14.63□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 B3GALT5-AS1P59052 145 aa14.62□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 SAMD5Q5TGI4 173 aa14.62□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa14.62□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 IGKV1-5P01602 117 aa14.62□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 AGMATQ9BSE5 352 aa14.62□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa14.62□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 A0A0J9YY99 117 aa14.62□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 TMEM238C9JI98 176 aa14.62□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 ZNF562Q6V9R5 426 aa14.62□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 THAP8Q8NA92 274 aa14.62□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa14.61□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 ASPHD1Q5U4P2 390 aa14.61□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 NKAPP1Q8N9T2 125 aa14.61□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 DOCK11Q5JSL3 2073 aa14.61□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 WDR83OSQ9Y284 106 aa14.61□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 J3QRE1 110 aa14.61□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 CD5P06127 495 aa14.61□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 TMEM126AQ9H061 195 aa14.61□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 CACNA1BQ00975 2339 aa14.61□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 NXPH4O95158 308 aa14.6□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 ID3Q02535 119 aa14.6□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa14.6□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 TRAV25A0A0B4J276 109 aa14.6□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 CFHR2P36980 270 aa14.6□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.6□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 A8MWV9 139 aa14.6□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 APOC4P55056 127 aa14.6□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 A0A087X0K7 114 aa14.59□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 TIMM21Q9BVV7 248 aa14.59□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 Q9HAA7 133 aa14.59□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa14.59□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.59□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 CXCL1P09341 107 aa14.59□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 ZNF479Q96JC4 524 aa14.59□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 NDUFB8O95169 186 aa14.59□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 ARMS2P0C7Q2 107 aa14.59□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 GAGE2EQ4V326 116 aa14.59□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 GAGE2DQ9UEU5 116 aa14.59□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 OOSP1A8MZH6 123 aa14.58□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 PCP4P48539 62 aa14.58□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
HCN4-201ENST00000261917 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HCN4-201ENST00000261917 MST1LQ2TV78 715 aa14.58□□□□□ -0.08
HCN4-201ENST00000261917 NDUFS8O00217 210 aa14.58□□□□□ -0.08
HCN4-201ENST00000261917 PMVKQ15126 192 aa14.58□□□□□ -0.08
HCN4-201ENST00000261917 DEFB136Q30KP8 78 aa14.58□□□□□ -0.08
HCN4-201ENST00000261917 LIME1Q9H400 295 aa14.58□□□□□ -0.08
HCN4-201ENST00000261917 FAM90A2PQ658T7 463 aa14.58□□□□□ -0.08
HCN4-201ENST00000261917 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.58□□□□□ -0.08
HCN4-201ENST00000261917 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa14.58□□□□□ -0.08
HCN4-201ENST00000261917 GUSBP1Q15486 140 aa14.58□□□□□ -0.08
HCN4-201ENST00000261917 ANAPC13Q9BS18 74 aa14.58□□□□□ -0.08
HCN4-201ENST00000261917 SNHG12Q9BXW3 62 aa14.58□□□□□ -0.08
HCN4-201ENST00000261917 GTF3C1Q12789 2109 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 646.8 ms