RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 SIGMAR1Q99720 223 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 ZGRF1Q86YA3 2104 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 CGB3P0DN86 165 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 CGB7P0DN87 165 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 PLXNB1O43157 2135 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 GLRXP35754 106 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 CR1LQ2VPA4 569 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 OR5A1Q8NGJ0 315 aa10.81□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 TACC2O95359 2948 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 PRSS47A8MTI9 375 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 IGHV1-46P01743 117 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 FAM106CPP0CH98 169 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 GCSHP23434 173 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 CFHR2P36980 270 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 CACNG7P62955 275 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 HSD52Q0P140 79 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 FAM106AQ4KMX7 169 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 SAMD5Q5TGI4 173 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 ASCL2Q99929 193 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 hADV38S2A0JD32 116 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 BMI1P35226 326 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 MZT1Q08AG7 82 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 PRNTQ86SH4 94 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 CUL9Q8IWT3 2517 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 PSMB11A5LHX3 300 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 DLL1O00548 723 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 CCL8P80075 99 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 WFDC3Q8IUB2 231 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 PCP2Q8IVA1 136 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 FAM169BQ8N8A8 192 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 GAFA1Q96PS6 74 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 PRSS22Q9GZN4 317 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 ARMS2P0C7Q2 107 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 FGF6P10767 208 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 OR1L8Q8NGR8 309 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 CACNG8Q8WXS5 425 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 ZNF714Q96N38 554 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 A0A1B0GV72 72 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 C10orf55Q5SWW7 151 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 ZNF788Q6ZQV5 615 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 MLST8Q9BVC4 326 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 A0A1B0GUT8 65 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 Q6ZS92 163 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 HARBI1Q96MB7 349 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 RNF7Q9UBF6 113 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 CSMD1Q96PZ7 3565 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 E7EUB6 86 aa10.77□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 SMIM13P0DJ93 91 aa10.77□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 APELAP0DMC3 54 aa10.77□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 PSG3Q16557 428 aa10.77□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP10.77□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 APC2O95996 2303 aa10.77□□□□□ -0.68
NISCH-212ENST00000488380 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa10.77□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 BOD1L2Q8IYS8 172 aa10.77□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 C19orf71A6NCJ1 209 aa10.77□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 TCRAP04437 139 aa10.77□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 CT45A6P0DMU7 189 aa10.77□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 CT45A5P0DMU8 189 aa10.77□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 CT45A7P0DMV0 189 aa10.77□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa10.77□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 FAM222BQ8WU58 562 aa10.77□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 FMC1Q96HJ9 113 aa10.77□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 Q9H3A6 140 aa10.77□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 LRBAP50851 2863 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 SMIM17P0DL12 118 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 CD40P25942 277 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 CT83Q5H943 113 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 IGFL3Q6UXB1 125 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 STXBP6Q8NFX7 210 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 OR9G4Q8NGQ1 327 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 TPRP12270 2363 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 CEP295Q9C0D2 2601 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 FCN3O75636 299 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 RIGQ13278 110 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 C16orf54Q6UWD8 224 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 Q71RC1 249 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 OR5AN1Q8NGI8 311 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 KLF12Q9Y4X4 402 aa10.76□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 DCHS2Q6V1P9 2916 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 K7ERJ3 54 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 HAX1O00165 279 aa10.75□□□□□ -0.69
NISCH-212ENST00000488380 LTAP01374 205 aa10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.8 ms