RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4F17Q8NGA8 305 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 C20orf24Q9BUV8 137 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 PARLQ9H300 379 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 RABAC1Q9UI14 185 aa7.85□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 HELTA6NFD8 242 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF98A6NK75 572 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHG4P01861 327 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 PYYP10082 97 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 RANP62826 216 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 TEX38Q6PEX7 206 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 FXYD5Q96DB9 178 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC140Q96MF4 163 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM160Q9NX00 188 aa7.84□□□□□ -1.15
RABGGTB-201ENST00000319942 APCP25054 2843 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A087WWC5 75 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 H3BRN7 92 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 ELANEP08246 267 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL7P18124 248 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 ARL3P36405 182 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 LEMD1Q68G75 181 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF343Q6P1L6 599 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 TOMM20LQ6UXN7 152 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 BLNKQ8WV28 456 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 HIST1H2BAQ96A08 127 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 KLK15Q9H2R5 256 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 TUBA4BQ9H853 241 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.83□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 PGPA6NDG6 321 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 MT-ND4LP03901 98 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 NPPCP23582 126 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 CRYBB3P26998 211 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 CFHR3Q02985 330 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 IL17RELQ6ZVW7 336 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 OR8I2Q8N0Y5 310 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 OR4X2Q8NGF9 303 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 C11orf52Q96A22 123 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR82Q96P67 336 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 METTL26Q96S19 204 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 NOTCH2Q04721 2471 aa7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 CXorf65A6NEN9 183 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFA4O00483 81 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 S100A9P06702 114 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 GP9P14770 177 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 FOXE3Q13461 319 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 PDE6HQ13956 83 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 ADIRFQ15847 76 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 C1orf194Q5T5A4 169 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM88Q6PEY1 159 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF329Q86UD4 541 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 Q8N2B8 174 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 ELOVL1Q9BW60 279 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF702PQ9H963 129 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 OTORQ9NRC9 128 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 EPDR1Q9UM22 224 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 TENM4Q6N022 2769 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 CR1P17927 2039 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 GGTLC3B5MD39 225 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 C9JCJ5 164 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 GGCTO75223 188 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
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RABGGTB-201ENST00000319942 RPL35P42766 123 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
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RABGGTB-201ENST00000319942 TAS2R60P59551 318 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM106AQ4KMX7 169 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.81□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP5D1E7EU14 171 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 CLDN34H7C241 214 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPAN4O14817 238 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3-11P01762 117 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 MYCNOSP40205 109 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 AKR1C3P42330 323 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 GALR1P47211 349 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 GNG4P50150 75 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 MEOX2P50222 304 aa7.8□□□□□ -1.16
RABGGTB-201ENST00000319942 PSG9Q00887 426 aa7.8□□□□□ -1.16
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