RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042824.12

Herc1-201, Transcript of HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Herc1, Length 15,153 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pitx3O35160 302 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Foxa2P35583 459 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 PnkdQ69ZP3 385 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Negr1Q80Z24 348 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rgp1Q8BHT7 391 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr262Q8VFV8 312 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Golt1bQ9CR60 138 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Hdhd3Q9CYW4 251 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tmem50bQ9D1X9 158 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dynlrb2Q9DAJ5 96 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ctnnbip1Q9JJN6 81 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Bcl2l10Q9Z0F3 191 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Sumo3Q9Z172 110 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ighv4-1A0A075B5R5 116 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm20219A0A1B0GRQ3 87 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm13762A2ATG2 311 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm20422E9PUR3 255 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cxcl1P12850 96 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Hist1h3aP68433 136 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 GpnmbQ99P91 574 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Bola1Q9D8S9 137 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 A730046J19RikA0A1B0GSN8 89 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cldn34c2J3QNM1 233 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 P01723 117 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Shc1P98083 579 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Defb21Q8C5Z4 100 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dleu7Q8CHZ8 209 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cldn34c1Q8K193 234 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Q9DAZ5 108 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cldn10Q9Z0S6 231 aa5.01□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 2410004P03RikA0A087WQY2 205 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zfp493E9Q1L8 384 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fabp4P04117 132 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Plxnb3Q9QY40 1902 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm14325A2AW67 498 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ascl4M0QW46 144 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 1700009N14RikQ14AA6 216 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc25a31Q3V132 320 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Lrrk1Q3UHC2 2014 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 P18529 117 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zfp36l2P23949 484 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Snai2P97469 269 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cdcp2Q8BQH6 427 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fbp1Q9QXD6 338 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm10428J3QNV7 132 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tlcd2Q8VC26 310 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tmem42Q9CR22 157 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rnf115Q9D0C1 305 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Prr30Q9D9B7 401 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Aifm1Q9Z0X1 612 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm14412A2ARR7 526 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Npas1P97459 594 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ndufv3Q8BK30 104 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Lpar6Q8BMC0 344 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc17a9Q8VCL5 447 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mettl26Q9DCS2 204 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr920E9Q413 310 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc35b1P97858 322 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zfp455Q7M6X9 461 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ptrh2Q8R2Y8 181 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mrpl43Q99N89 183 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cst10Q9JM84 148 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Trav7n-5A0A075B604 112 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr918E9PVZ7 325 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Ube2l3P68037 154 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Srsf7Q8BL97 267 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm10190Q8BSD7 107 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Bricd5Q8BV89 174 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr95Q8VFE2 312 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Anapc16Q9CPV2 110 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Mrpl13Q9D1P0 178 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 NbasE9Q411 2356 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Prss28Q924N9 274 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Tmem208Q9CR96 173 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 RetnlaQ9EP95 111 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Dmrtb1A2A9I7 359 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Zfp362B1ASA5 418 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 BsgP18572 389 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr1437Q7TQR7 312 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rpl24Q8BP67 157 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 9030612E09RikQ8CE20 140 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr609E9Q4X7 319 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Slc25a5P51881 298 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rnd3P61588 244 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pla2g5P97391 137 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Bpifb3Q80ZU7 473 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 MavsQ8VCF0 503 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr354Q8VGJ8 317 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 FmodP50608 376 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 IcaQ9DBD0 700 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Fer1l4A3KGK3 1992 aa5□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr175-ps1A0A140T8K4 308 aa4.99□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Pusl1A2ADA5 291 aa4.99□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Plcxd2B2RXA1 340 aa4.99□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Rag2P21784 527 aa4.99□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Bcl2l2P70345 193 aa4.99□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Olfr141Q60880 325 aa4.99□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Znf511Q6P0X2 227 aa4.99□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Cbln4Q8BME9 198 aa4.99□□□□□ -1.61
Herc1-201ENSMUST00000042824 Gm20767O70517 169 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 79.8 ms