Protein–RNA interactions for Protein: P97858

Slc35b1, Solute carrier family 35 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35b1P97858 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Slc35b1P97858 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc35b1P97858 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc35b1P97858 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Slc35b1P97858 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Slc35b1P97858 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Slc35b1P97858 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc35b1P97858 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc35b1P97858 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc35b1P97858 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Slc35b1P97858 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Slc35b1P97858 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Slc35b1P97858 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Slc35b1P97858 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc35b1P97858 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc35b1P97858 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc35b1P97858 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc35b1P97858 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc35b1P97858 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Slc35b1P97858 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc35b1P97858 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc35b1P97858 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Slc35b1P97858 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slc35b1P97858 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc35b1P97858 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slc35b1P97858 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc35b1P97858 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc35b1P97858 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc35b1P97858 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc35b1P97858 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc35b1P97858 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc35b1P97858 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc35b1P97858 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc35b1P97858 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc35b1P97858 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc35b1P97858 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc35b1P97858 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc35b1P97858 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc35b1P97858 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slc35b1P97858 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc35b1P97858 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc35b1P97858 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slc35b1P97858 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc35b1P97858 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc35b1P97858 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc35b1P97858 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc35b1P97858 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc35b1P97858 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc35b1P97858 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc35b1P97858 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc35b1P97858 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc35b1P97858 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc35b1P97858 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc35b1P97858 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc35b1P97858 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc35b1P97858 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc35b1P97858 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc35b1P97858 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc35b1P97858 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc35b1P97858 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc35b1P97858 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc35b1P97858 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc35b1P97858 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc35b1P97858 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc35b1P97858 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc35b1P97858 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc35b1P97858 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc35b1P97858 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc35b1P97858 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc35b1P97858 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc35b1P97858 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc35b1P97858 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc35b1P97858 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc35b1P97858 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc35b1P97858 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc35b1P97858 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc35b1P97858 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc35b1P97858 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc35b1P97858 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc35b1P97858 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc35b1P97858 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc35b1P97858 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc35b1P97858 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc35b1P97858 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc35b1P97858 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc35b1P97858 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc35b1P97858 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc35b1P97858 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc35b1P97858 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc35b1P97858 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc35b1P97858 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc35b1P97858 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc35b1P97858 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc35b1P97858 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc35b1P97858 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc35b1P97858 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc35b1P97858 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc35b1P97858 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc35b1P97858 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc35b1P97858 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms