Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Negr1Q80Z24 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Negr1Q80Z24 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Negr1Q80Z24 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Negr1Q80Z24 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Negr1Q80Z24 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Negr1Q80Z24 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Negr1Q80Z24 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Negr1Q80Z24 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Negr1Q80Z24 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Negr1Q80Z24 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Negr1Q80Z24 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Negr1Q80Z24 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Negr1Q80Z24 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Negr1Q80Z24 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Negr1Q80Z24 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Negr1Q80Z24 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Negr1Q80Z24 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Negr1Q80Z24 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Negr1Q80Z24 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Negr1Q80Z24 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Negr1Q80Z24 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Negr1Q80Z24 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Negr1Q80Z24 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Negr1Q80Z24 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Negr1Q80Z24 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Negr1Q80Z24 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Negr1Q80Z24 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Negr1Q80Z24 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Negr1Q80Z24 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Negr1Q80Z24 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Negr1Q80Z24 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Negr1Q80Z24 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Negr1Q80Z24 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Negr1Q80Z24 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Negr1Q80Z24 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Negr1Q80Z24 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Negr1Q80Z24 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Negr1Q80Z24 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Negr1Q80Z24 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Negr1Q80Z24 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Negr1Q80Z24 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Negr1Q80Z24 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Negr1Q80Z24 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Negr1Q80Z24 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Negr1Q80Z24 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Negr1Q80Z24 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Negr1Q80Z24 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Negr1Q80Z24 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Negr1Q80Z24 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Negr1Q80Z24 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Negr1Q80Z24 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Negr1Q80Z24 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Negr1Q80Z24 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Negr1Q80Z24 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Negr1Q80Z24 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Negr1Q80Z24 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Negr1Q80Z24 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Negr1Q80Z24 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Negr1Q80Z24 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Negr1Q80Z24 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Negr1Q80Z24 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Negr1Q80Z24 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Negr1Q80Z24 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Negr1Q80Z24 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Negr1Q80Z24 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Negr1Q80Z24 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Negr1Q80Z24 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Negr1Q80Z24 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Negr1Q80Z24 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Negr1Q80Z24 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Negr1Q80Z24 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Negr1Q80Z24 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Negr1Q80Z24 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Negr1Q80Z24 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Negr1Q80Z24 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Negr1Q80Z24 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Negr1Q80Z24 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Negr1Q80Z24 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Negr1Q80Z24 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Negr1Q80Z24 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Negr1Q80Z24 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Negr1Q80Z24 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Negr1Q80Z24 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Negr1Q80Z24 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Negr1Q80Z24 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Negr1Q80Z24 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Negr1Q80Z24 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Negr1Q80Z24 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Negr1Q80Z24 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Negr1Q80Z24 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Negr1Q80Z24 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Negr1Q80Z24 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Negr1Q80Z24 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Negr1Q80Z24 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Negr1Q80Z24 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Negr1Q80Z24 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Negr1Q80Z24 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Negr1Q80Z24 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Negr1Q80Z24 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms