Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Mrpl43Q99N89 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Mrpl43Q99N89 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Mrpl43Q99N89 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Mrpl43Q99N89 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Mrpl43Q99N89 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Mrpl43Q99N89 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Mrpl43Q99N89 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mrpl43Q99N89 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mrpl43Q99N89 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mrpl43Q99N89 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Mrpl43Q99N89 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Mrpl43Q99N89 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Mrpl43Q99N89 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Mrpl43Q99N89 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mrpl43Q99N89 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mrpl43Q99N89 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Mrpl43Q99N89 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mrpl43Q99N89 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Mrpl43Q99N89 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mrpl43Q99N89 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mrpl43Q99N89 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mrpl43Q99N89 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mrpl43Q99N89 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mrpl43Q99N89 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mrpl43Q99N89 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mrpl43Q99N89 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Mrpl43Q99N89 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Mrpl43Q99N89 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mrpl43Q99N89 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Mrpl43Q99N89 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Mrpl43Q99N89 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Mrpl43Q99N89 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Mrpl43Q99N89 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Mrpl43Q99N89 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Mrpl43Q99N89 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Mrpl43Q99N89 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Mrpl43Q99N89 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Mrpl43Q99N89 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Mrpl43Q99N89 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Mrpl43Q99N89 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mrpl43Q99N89 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Mrpl43Q99N89 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Mrpl43Q99N89 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Mrpl43Q99N89 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mrpl43Q99N89 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mrpl43Q99N89 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mrpl43Q99N89 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mrpl43Q99N89 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mrpl43Q99N89 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mrpl43Q99N89 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mrpl43Q99N89 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mrpl43Q99N89 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mrpl43Q99N89 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mrpl43Q99N89 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mrpl43Q99N89 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mrpl43Q99N89 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Mrpl43Q99N89 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Mrpl43Q99N89 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Mrpl43Q99N89 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Mrpl43Q99N89 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Mrpl43Q99N89 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Mrpl43Q99N89 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mrpl43Q99N89 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Mrpl43Q99N89 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Mrpl43Q99N89 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Mrpl43Q99N89 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mrpl43Q99N89 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Mrpl43Q99N89 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Mrpl43Q99N89 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Mrpl43Q99N89 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Mrpl43Q99N89 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Mrpl43Q99N89 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Mrpl43Q99N89 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Mrpl43Q99N89 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Mrpl43Q99N89 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Mrpl43Q99N89 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mrpl43Q99N89 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mrpl43Q99N89 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mrpl43Q99N89 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mrpl43Q99N89 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mrpl43Q99N89 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mrpl43Q99N89 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mrpl43Q99N89 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mrpl43Q99N89 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Mrpl43Q99N89 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mrpl43Q99N89 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Mrpl43Q99N89 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Mrpl43Q99N89 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Mrpl43Q99N89 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mrpl43Q99N89 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mrpl43Q99N89 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mrpl43Q99N89 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mrpl43Q99N89 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mrpl43Q99N89 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Mrpl43Q99N89 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mrpl43Q99N89 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Mrpl43Q99N89 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Mrpl43Q99N89 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Mrpl43Q99N89 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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