Protein–RNA interactions for Protein: P21784

Rag2, V(D)J recombination-activating protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag2P21784 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rag2P21784 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rag2P21784 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rag2P21784 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rag2P21784 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rag2P21784 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Rag2P21784 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rag2P21784 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rag2P21784 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rag2P21784 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rag2P21784 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rag2P21784 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rag2P21784 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rag2P21784 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rag2P21784 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rag2P21784 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rag2P21784 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rag2P21784 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rag2P21784 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rag2P21784 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rag2P21784 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rag2P21784 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rag2P21784 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rag2P21784 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rag2P21784 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rag2P21784 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rag2P21784 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rag2P21784 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rag2P21784 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rag2P21784 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rag2P21784 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rag2P21784 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rag2P21784 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rag2P21784 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rag2P21784 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rag2P21784 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rag2P21784 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rag2P21784 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rag2P21784 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rag2P21784 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rag2P21784 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rag2P21784 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rag2P21784 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rag2P21784 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rag2P21784 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rag2P21784 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Rag2P21784 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rag2P21784 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rag2P21784 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rag2P21784 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rag2P21784 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rag2P21784 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rag2P21784 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rag2P21784 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rag2P21784 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rag2P21784 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rag2P21784 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rag2P21784 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rag2P21784 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rag2P21784 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rag2P21784 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rag2P21784 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rag2P21784 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rag2P21784 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rag2P21784 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rag2P21784 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rag2P21784 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rag2P21784 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rag2P21784 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rag2P21784 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rag2P21784 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rag2P21784 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rag2P21784 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rag2P21784 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rag2P21784 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rag2P21784 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rag2P21784 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rag2P21784 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rag2P21784 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rag2P21784 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rag2P21784 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rag2P21784 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rag2P21784 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rag2P21784 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rag2P21784 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rag2P21784 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rag2P21784 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rag2P21784 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rag2P21784 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rag2P21784 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rag2P21784 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rag2P21784 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rag2P21784 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rag2P21784 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rag2P21784 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rag2P21784 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rag2P21784 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rag2P21784 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rag2P21784 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rag2P21784 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms