RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	VID27	P40157	782 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	GTS1	P40956	396 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	SHR5	P41912	237 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	YFH7	P43591	353 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	EAF6	P47128	113 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	UBA2	P52488	636 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	AIM14	P53109	570 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	STE23	Q06010	1027 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	ATG33	Q06485	197 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	DIF1	O13577	133 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	SNF3	P10870	884 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	HMG1	P12683	1054 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	CHS2	P14180	963 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	CKA2	P19454	339 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	APL1	P27351	700 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	SEC6	P32844	805 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	PTC7	P38797	343 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	PIP2	P52960	996 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	PUS2	P53167	370 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	IRC4	Q03036	179 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	YPL034W	Q03083	165 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	VTI1	Q04338	217 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	SOV1	Q04748	898 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	YOL075C	Q08234	1294 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	DSE3	Q08729	430 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	BUG1	Q12191	341 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PSH1	YOL054W	TUS1	Q06412	1307 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	RAD1	P06777	1100 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	OM45	P16547	393 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	RPC53	P25441	422 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	KRE2	P27809	442 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	MAC1	P35192	417 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	RPC25	P35718	212 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	HSL7	P38274	827 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	YSW1	P38280	609 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	PEX7	P39108	375 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	IES1	P43579	692 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	TRS85	P46944	698 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	BTN2	P53286	410 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	COG6	P53959	839 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	RSM24	Q03976	319 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	UBX2	Q04228	584 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	SLX4	Q12098	748 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	FLO1	P32768	1537 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	PRC1	P00729	532 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	SAS3	P34218	831 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	PES4	P39684	611 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	XYL2	Q07993	356 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	PMD1	P32634	1753 aa		6.01	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	SRP101	P32916	621 aa		6	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	STE13	P33894	931 aa		6	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	6	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	DAS1	P47005	663 aa		6	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	SGM1	P47166	707 aa		6	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	ENV11	P53246	860 aa		6	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	MDM1	Q01846	1127 aa		6	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	SND1	Q04007	877 aa		6	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	NUC1	P08466	329 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	HSF1	P10961	833 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	TUP1	P16649	713 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	AEP2	P22136	580 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	ADP1	P25371	1049 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	YCL002C	P25565	263 aa		5.99	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
PSH1	YOL054W	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45

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