RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	PEX18	P38855	283 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	RIC1	P40395	1056 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	ZIM17	P42844	174 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	GCV1	P48015	400 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	VHS3	Q08438	674 aa		4.66	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	PMD1	P32634	1753 aa		4.65	□□□□□ -1.66
KTR2	YKR061W	ENA1	P13587	1091 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	POL3	P15436	1097 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	CKA1	P15790	372 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	OM45	P16547	393 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	PUP2	P32379	260 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	SMI1	P32566	505 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	UGA4	P32837	571 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	UIP5	P36137	443 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	NUP133	P36161	1157 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	RVS167	P39743	482 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	MDE1	P47095	244 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	RSM26	P47141	266 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	JJJ1	P53863	590 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	TEP1	P53916	434 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	TIM10	P87108	93 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	ENA2	Q01896	1091 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	SKY1	Q03656	742 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	ENA5	Q12691	1091 aa		4.65	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	TOM1	Q03280	3268 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	CDC9	P04819	755 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	INO1	P11986	533 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
KTR2	YKR061W	PYC2	P32327	1180 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	RAD24	P32641	659 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	LOT5	P34234	306 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	RER2	P35196	286 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	RDH54	P38086	958 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	YBL028C	P38202	106 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	CCZ1	P38273	704 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	HSL7	P38274	827 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	CTM1	P38818	585 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	STL1	P39932	569 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	ALG2	P43636	503 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	YJL055W	P47044	245 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	YGR153W	P48238	217 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	GNP1	P48813	663 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	SAP4	P53036	818 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	GIM3	P53900	129 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	EOS1	P53938	366 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	ORC3	P54790	616 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	CTR9	P89105	1077 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	FDC1	Q03034	503 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	HOT1	Q03213	719 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	CIA1	Q05583	330 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	MCP2	Q06567	569 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	NFI1	Q12216	726 aa		4.64	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
KTR2	YKR061W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
KTR2	YKR061W	TOP3	P13099	656 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	GRR1	P24814	1151 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	YKL107W	P34251	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	SWH1	P35845	1188 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	GPT2	P36148	743 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	MTG2	P38860	518 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	SHC1	P39000	512 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	AIM20	P40451	204 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	YIL092W	P40497	633 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	RMD8	P43620	662 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	HOP2	P53187	214 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	SIW14	P53965	281 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	YPL071C	Q02864	156 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	YML119W	Q03208	357 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	CSI1	Q04368	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	PHO92	Q06390	306 aa		4.63	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	MDM36	Q06820	579 aa		4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 7.4 ms