RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BRF1-222	ENST00000635152	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
BRF1-222	ENST00000635152	ZBTB43	O43298	467 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BRF1-222	ENST00000635152	CAVIN2	O95810	425 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BRF1-222	ENST00000635152	ANO1	Q5XXA6	986 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BRF1-222	ENST00000635152	BRAP	Q7Z569	592 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BRF1-222	ENST00000635152	VPS37D	Q86XT2	251 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BRF1-222	ENST00000635152	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		15.22	■□□□□ 0.03
BRF1-222	ENST00000635152	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BRF1-222	ENST00000635152	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
BRF1-222	ENST00000635152	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
BRF1-222	ENST00000635152	SIK1	P57059	783 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BRF1-222	ENST00000635152	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
BRF1-222	ENST00000635152	KRT40	Q6A162	431 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BRF1-222	ENST00000635152	ISM2	Q6H9L7	571 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BRF1-222	ENST00000635152	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
BRF1-222	ENST00000635152	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BRF1-222	ENST00000635152	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
BRF1-222	ENST00000635152	SLIT2	O94813	1529 aa		15.21	■□□□□ 0.03
BRF1-222	ENST00000635152	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	DYNC1I1	O14576	645 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	ITPK1	Q13572	414 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	ARID5B	Q14865	1188 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		15.21	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	YEATS4	O95619	227 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	TDO2	P48775	406 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	LCORL	Q8N3X6	602 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	LY9	Q9HBG7	655 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PQ27	194 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PQ64	194 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PQD8	194 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	ABCF2	Q9UG63	623 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	NUP98	P52948	1817 aa		15.2	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	CDKL5	O76039	1030 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	CAMTA2	O94983	1202 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF202	O95125	648 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	KCNQ4	P56696	695 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	ATRN	O75882	1429 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC69	A6NI79	296 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM87B	Q96K49	555 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	MYH7	P12883	1935 aa		15.19	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	PFKFB1	P16118	471 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	CHRND	Q07001	517 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	KCNQ2	O43526	872 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	SMIM5	Q71RC9	77 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	MYH3	P11055	1940 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	TRIM29	Q14134	588 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	NTRK3	Q16288	839 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		15.18	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	CLIC6	Q96NY7	704 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	15.17	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	SMIM22	K7EJ46	135 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	NTSR2	O95665	410 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	GUCY1A2	P33402	732 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	GYG1	P46976	350 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	SLC39A14	Q15043	492 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	SARM1	Q6SZW1	724 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	AK7	Q96M32	723 aa		15.17	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	ALX1	Q15699	326 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		15.16	■□□□□ 0.02
BRF1-222	ENST00000635152	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		15.16	■□□□□ 0.02

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