RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 CTSWP56202 376 aa15.13■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 TCP10L2B9ZVM9 353 aa15.12■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 NFE2L2Q16236 605 aa15.12■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 C9orf50Q5SZB4 431 aa15.12■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 PLEKHF1Q96S99 279 aa15.12■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 LRFN3Q9BTN0 628 aa15.12■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 BABAM1Q9NWV8 329 aa15.12■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 DOCK3Q8IZD9 2030 aa15.11■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 IL1R1P14778 569 aa15.11■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 TRIM32Q13049 653 aa15.11■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 SHHQ15465 462 aa15.11■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa15.11■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 GREM2Q9H772 168 aa15.11■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 THEGQ9P2T0 379 aa15.11■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 SERPINA10Q9UK55 444 aa15.11■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 A0A1B0GUL6 1792 aa15.11■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP15.1■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 KRT24Q2M2I5 525 aa15.1■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 TTLL11Q8NHH1 800 aa15.1■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP15.1■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 MYH3P11055 1940 aa15.09■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 INPP5BP32019 993 aa15.09■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 TNNI2P48788 182 aa15.09■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 GRIN2CQ14957 1233 aa15.09■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 CCDC191Q8NCU4 936 aa15.09■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
HCG18-241ENST00000602290 TAOK2Q9UL54 1235 aa15.08■□□□□ 0
HCG18-241ENST00000602290 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.08■□□□□ 0
HCG18-241ENST00000602290 ANKRD2Q9GZV1 360 aa15.07■□□□□ 0
HCG18-241ENST00000602290 JAG2Q9Y219 1238 aa15.07■□□□□ 0
HCG18-241ENST00000602290 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
HCG18-241ENST00000602290 CHD9Q3L8U1 2897 aa15.06■□□□□ 0
HCG18-241ENST00000602290 SNAP23O00161 211 aa15.06■□□□□ 0
HCG18-241ENST00000602290 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
HCG18-241ENST00000602290 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
HCG18-241ENST00000602290 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa15.06■□□□□ 0
HCG18-241ENST00000602290 TRIB2Q92519 343 aa15.06■□□□□ 0
HCG18-241ENST00000602290 COA7Q96BR5 231 aa15.06■□□□□ 0
HCG18-241ENST00000602290 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
HCG18-241ENST00000602290 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
HCG18-241ENST00000602290 ZNF112Q9UJU3 913 aa15.06■□□□□ 0
HCG18-241ENST00000602290 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa15.06■□□□□ 0
HCG18-241ENST00000602290 PLXNB2O15031 1838 aa15.06■□□□□ 0
HCG18-241ENST00000602290 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 GJD2Q9UKL4 321 aa15.05■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 FRMPD3Q5JV73 1810 aa15.04■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 CXCL11O14625 94 aa15.04■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 HOXB7P09629 217 aa15.04■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 CACNB3P54284 484 aa15.04■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 CHRNDQ07001 517 aa15.04■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 FAM110CQ1W6H9 321 aa15.04■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 FAM83AQ86UY5 434 aa15.04■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 MYD88Q99836 296 aa15.04■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 ZNF341Q9BYN7 854 aa15.04■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 C11orf16Q9NQ32 467 aa15.04■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 HYPKQ9NX55 129 aa15.04■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 PTPRFP10586 1907 aa15.04■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 CRKP46108 304 aa15.03■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 AKNAD1Q5T1N1 836 aa15.03■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 DCAF15Q66K64 600 aa15.03■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 LHX8Q68G74 356 aa15.03■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 POTEEQ6S8J3 1075 aa15.03■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 EPHX3Q9H6B9 360 aa15.03■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 REV3LO60673 3130 aa15.03■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 MRE11P49959 708 aa15.02■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 TMEM31Q5JXX7 168 aa15.02■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 MFSD14BQ5SR56 506 aa15.02■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 ZNF804AQ7Z570 1209 aa15.02■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 RIC3Q7Z5B4 369 aa15.02■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 HOOK2Q96ED9 719 aa15.02■□□□□ -0
HCG18-241ENST00000602290 PPP2R1AP30153 589 aa15.01□□□□□ -0.01
HCG18-241ENST00000602290 KCNJ4P48050 445 aa15.01□□□□□ -0.01
HCG18-241ENST00000602290 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
HCG18-241ENST00000602290 FKBP1CQ5VVH2 108 aa15.01□□□□□ -0.01
HCG18-241ENST00000602290 CHD7Q9P2D1 2997 aa15□□□□□ -0.01
HCG18-241ENST00000602290 NEFMP07197 916 aa15□□□□□ -0.01
HCG18-241ENST00000602290 BMP1P13497 986 aa15□□□□□ -0.01
HCG18-241ENST00000602290 DNAJB2P25686 324 aa15□□□□□ -0.01
HCG18-241ENST00000602290 GOLGA2Q08379 1002 aa15□□□□□ -0.01
HCG18-241ENST00000602290 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa15□□□□□ -0.01
HCG18-241ENST00000602290 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.99□□□□□ -0.01
HCG18-241ENST00000602290 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
HCG18-241ENST00000602290 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
HCG18-241ENST00000602290 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa14.99□□□□□ -0.01
HCG18-241ENST00000602290 AK9Q5TCS8 1911 aa14.99□□□□□ -0.01
HCG18-241ENST00000602290 CHL1O00533 1208 aa14.98□□□□□ -0.01
HCG18-241ENST00000602290 GPR37L1O60883 481 aa14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.8 ms