RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 LAMA4Q16363 1823 aa17.51■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 GYG1P46976 350 aa17.51■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 EVX2Q03828 476 aa17.51■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 SPATA5Q8NB90 893 aa17.51■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 SDR42E1Q8WUS8 393 aa17.51■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 TIGD1Q96MW7 591 aa17.51■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 LAMB4A4D0S4 1761 aa17.51■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa17.51■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa17.5■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa17.5■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 SIK1P57059 783 aa17.5■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 LCORLQ8N3X6 602 aa17.5■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 PLA2G12BQ9BX93 195 aa17.5■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 SALL1Q9NSC2 1324 aa17.5■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 MINDY4BA8MYZ0 360 aa17.5■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP17.5■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 RCOR1Q9UKL0 485 aa17.5■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 RFX7Q2KHR2 1363 aa17.49■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 KINO60870 393 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 PSMD1Q99460 953 aa17.49■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 SHANK3Q9BYB0 1731 aa17.49■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 PRDM1O75626 825 aa17.49■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP17.49■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa17.49■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 ZNF34Q8IZ26 560 aa17.49■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 ZSWIM5Q9P217 1185 aa17.49■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 LRP2BPQ9P2M1 347 aa17.49■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 STRCQ7RTU9 1775 aa17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 CCDC144BQ3MJ40 725 aa17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 ADGRA1Q86SQ6 560 aa17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 NAPBQ9H115 298 aa17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 CCDC87Q9NVE4 849 aa17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 GUCY1A2P33402 732 aa17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 EIF5P55010 431 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 TMEM67Q5HYA8 995 aa17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 NUP133Q8WUM0 1156 aa17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 PRIMPOLQ96LW4 560 aa17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 CLIC6Q96NY7 704 aa17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 ALG1Q9BT22 464 aa17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 UBR2Q8IWV8 1755 aa17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 PIBF1Q8WXW3 757 aa17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 LPIN2Q92539 896 aa17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 TDO2P48775 406 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 IFNL3Q8IZI9 196 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 KCNJ14Q9UNX9 436 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 SLC26A6Q9BXS9 759 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa17.47■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 SLIT2O94813 1529 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 CCDC66A2RUB6 948 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 KLRK1P26718 216 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 APOA5Q6Q788 366 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 AOPEPQ8N6M6 819 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP17.46■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 CDHR2Q9BYE9 1310 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 BECN2A8MW95 431 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 CHRNDQ07001 517 aa17.46■□□□□ 0.39
CTIF-205ENST00000587860 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-205ENST00000587860 SLC5A1P13866 664 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-205ENST00000587860 ERFEQ4G0M1 354 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-205ENST00000587860 MYSM1Q5VVJ2 828 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-205ENST00000587860 LINC00301Q8NCQ3 95 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-205ENST00000587860 NWD2Q9ULI1 1742 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-205ENST00000587860 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
CTIF-205ENST00000587860 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
CTIF-205ENST00000587860 SLFN14P0C7P3 912 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-205ENST00000587860 DPCR1Q3MIW9 517 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-205ENST00000587860 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
CTIF-205ENST00000587860 RAI14Q9P0K7 980 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-205ENST00000587860 CLIP2Q9UDT6 1046 aa17.45■□□□□ 0.38
CTIF-205ENST00000587860 CAMTA2O94983 1202 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-205ENST00000587860 ZNF75DP51815 510 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-205ENST00000587860 KRT40Q6A162 431 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-205ENST00000587860 ENGASEQ8NFI3 743 aa17.44■□□□□ 0.38
CTIF-205ENST00000587860 GOLGA8AA7E2F4 631 aa17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms