RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 FKBP1CQ5VVH2 108 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 FAM83AQ86UY5 434 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 BTBD19C9JJ37 291 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 IRF6O14896 467 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 FGFR2P21802 821 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 PPIL2Q13356 520 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 SNAPC2Q13487 334 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 KIF22Q14807 665 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 METTL24Q5JXM2 366 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.37□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 H0YGN5 161 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 ZBTB22O15209 634 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 CIAO1O76071 339 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 GNAI3P08754 354 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 TRIM27P14373 513 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 MTX1Q13505 466 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 C17orf99Q6UX52 265 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 ATG9AQ7Z3C6 839 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 KLHDC4Q8TBB5 520 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 TEKT1Q969V4 418 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 HOOK2Q96ED9 719 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 WRNIP1Q96S55 665 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.36□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 BCAR3O75815 825 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 CACNB3P54284 484 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 PPATQ06203 517 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 CAVIN4Q5BKX8 364 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 MEIS3Q99687 375 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 COPRSQ9NQ92 184 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.35□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 CTGFP29279 349 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 VPS37DQ86XT2 251 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 SHISA4Q96DD7 197 aa14.34□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP14.34□□□□□ -0.11
CS-221ENST00000550734 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.33□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 DCAF15Q66K64 600 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 ANKRD23Q86SG2 305 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 LPIN2Q92539 896 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 SRRDQ9UH36 339 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.33□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP14.32□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 MTFR1Q15390 333 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 TRIM47Q96LD4 638 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 KCNH4Q9UQ05 1017 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 MAST3O60307 1309 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.31□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 HOXD10P28358 340 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 PSMC4P43686 418 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 GJA8P48165 433 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 BCAMP50895 628 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 MOGSQ13724 837 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 FAM151AQ8WW52 585 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 CPA4Q9UI42 421 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 LAMA3Q16787 3333 aa14.3□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 PDHXO00330 501 aa14.3□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 GJB1P08034 283 aa14.3□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 SLC5A1P13866 664 aa14.3□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 OSBPP22059 807 aa14.3□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 INPP5BP32019 993 aa14.3□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 GRK4P32298 578 aa14.3□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.3□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.3□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 PRO3102Q9H379 93 aa14.3□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 MGAMO43451 1857 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 GNAI2P04899 355 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 ATP2B3Q16720 1220 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 RAET1EQ8TD07 263 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 DPF3Q92784 378 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 SIL1Q9H173 461 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 TNNQ9UQP3 1299 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 SEMA3EO15041 775 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 SRGAP3O43295 1099 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 BCRP11274 1271 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 CCL5P13501 91 aa14.28□□□□□ -0.12
CS-221ENST00000550734 MYPNQ86TC9 1320 aa14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.2 ms