RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.56■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 OSBPL3Q9H4L5 887 aa20.56■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 MX1P20591 662 aa20.55■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 PRKG1Q13976 671 aa20.55■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa20.55■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 ZNF333Q96JL9 665 aa20.55■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 LAMA3Q16787 3333 aa20.55■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 PDE1AP54750 535 aa20.54■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 CCDC102BQ68D86 513 aa20.54■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.54■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.54■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.54■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 ALDH1A1P00352 501 aa20.53■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 ATP5JP18859 108 aa20.53■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 PHKA1P46020 1223 aa20.53■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 GYG1P46976 350 aa20.53■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.53■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.53■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 GPATCH3Q96I76 525 aa20.53■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.52■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 IL1R1P14778 569 aa20.52■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 BCAMP50895 628 aa20.52■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 CRHR2Q13324 411 aa20.52■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.52■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 DACT2Q5SW24 774 aa20.52■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 PI4K2BQ8TCG2 481 aa20.52■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.52■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 COA1Q9GZY4 146 aa20.52■□□□□ 0.88
PACS1-208ENST00000529677 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 USP17L3A6NCW0 530 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 USP17L4A6NCW7 530 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 SEMA3EO15041 775 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 GJA5P36382 358 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 GORABQ5T7V8 394 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.51■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 OTOFQ9HC10 1997 aa20.5■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 ERO1AQ96HE7 468 aa20.5■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 WNK4Q96J92 1243 aa20.5■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 PTPN18Q99952 460 aa20.5■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 PRO3102Q9H379 93 aa20.5■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 CD209Q9NNX6 404 aa20.5■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 ERC2O15083 957 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 SKAP1Q86WV1 359 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 EFCC1Q9HA90 598 aa20.49■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 RASGRF1Q13972 1273 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 MAP3K11Q16584 847 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 PODNQ7Z5L7 613 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 VPS37DQ86XT2 251 aa20.48■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 G3V3G9 751 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 NF2P35240 595 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 MCAMP43121 646 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 TSHZ3Q63HK5 1081 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 HAUS7Q99871 368 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 BCL11AQ9H165 835 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 DOCK2Q92608 1830 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.47■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 INHBEP58166 350 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 DENND2AQ9ULE3 1009 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 ECM29Q5VYK3 1845 aa20.46■□□□□ 0.87
PACS1-208ENST00000529677 TTC22Q5TAA0 569 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 SPATA5Q8NB90 893 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 SHISA4Q96DD7 197 aa20.45■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 RGS3P49796 1198 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 SP3Q02447 781 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.44■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.43■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.43■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.42■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 MYCP01106 439 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 ZAP70P43403 619 aa20.42■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 PI16Q6UXB8 463 aa20.42■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.42■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 AK9Q5TCS8 1911 aa20.41■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 UNC80Q8N2C7 3258 aa20.41■□□□□ 0.86
PACS1-208ENST00000529677 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
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