RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493715.1

CHTF18-212, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 3

Gene CHTF18, Length 691 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-212ENST00000493715 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
CHTF18-212ENST00000493715 MEIS3Q99687 375 aa17.1■□□□□ 0.33
CHTF18-212ENST00000493715 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
CHTF18-212ENST00000493715 SZT2Q5T011 3432 aa17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-212ENST00000493715 PDE8BO95263 885 aa17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-212ENST00000493715 CRKP46108 304 aa17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-212ENST00000493715 ARHGAP45Q92619 1136 aa17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-212ENST00000493715 SHISA4Q96DD7 197 aa17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-212ENST00000493715 HOOK2Q96ED9 719 aa17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-212ENST00000493715 WRNIP1Q96S55 665 aa17.09■□□□□ 0.33
CHTF18-212ENST00000493715 BTBD19C9JJ37 291 aa17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 EYA2O00167 538 aa17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 DLL1O00548 723 aa17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 TRIM27P14373 513 aa17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 HOXD10P28358 340 aa17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 MTFR1Q15390 333 aa17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 SLC17A8Q8NDX2 589 aa17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 RAET1EQ8TD07 263 aa17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa17.08■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 FGFR2P21802 821 aa17.07■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 PPIL2Q13356 520 aa17.07■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 ATG9AQ7Z3C6 839 aa17.07■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 FBXO33Q7Z6M2 555 aa17.07■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 TMOD2Q9NZR1 351 aa17.07■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 SRRDQ9UH36 339 aa17.07■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 NR2E3Q9Y5X4 410 aa17.07■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 IRF6O14896 467 aa17.06■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 GRK4P32298 578 aa17.06■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 PSMC4P43686 418 aa17.06■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 SIL1Q9H173 461 aa17.06■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 GJA8P48165 433 aa17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 BCAMP50895 628 aa17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 UBXN2AP68543 259 aa17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 DCAF15Q66K64 600 aa17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 VPS37DQ86XT2 251 aa17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 TRIM47Q96LD4 638 aa17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 CPA4Q9UI42 421 aa17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 MYPNQ86TC9 1320 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 GJB1P08034 283 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 CCL5P13501 91 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 OSBPP22059 807 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 CACNB3P54284 484 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 GRIK5Q16478 980 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 CAVIN4Q5BKX8 364 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 C17orf99Q6UX52 265 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 TEKT1Q969V4 418 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 CLUAP1Q96AJ1 413 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 RNF208Q9H0X6 261 aa17.04■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 ZBED9Q6R2W3 1325 aa17.03■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 PPATQ06203 517 aa17.03■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 ANKRD23Q86SG2 305 aa17.03■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 FAM83AQ86UY5 434 aa17.03■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 A0A1W2PPC1 479 aa17.02■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 CIAO1O76071 339 aa17.02■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 GNAI3P08754 354 aa17.02■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 SLC5A1P13866 664 aa17.02■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa17.02■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 LPIN2Q92539 896 aa17.02■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF341Q9BYN7 854 aa17.02■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 PRO3102Q9H379 93 aa17.02■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 FBXO3Q9UK99 471 aa17.02■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 HDAC5Q9UQL6 1122 aa17.02■□□□□ 0.32
CHTF18-212ENST00000493715 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.31
CHTF18-212ENST00000493715 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
CHTF18-212ENST00000493715 PDHXO00330 501 aa17.01■□□□□ 0.31
CHTF18-212ENST00000493715 CTGFP29279 349 aa17.01■□□□□ 0.31
CHTF18-212ENST00000493715 FKBP1CQ5VVH2 108 aa17.01■□□□□ 0.31
CHTF18-212ENST00000493715 TMEM57Q8N5G2 664 aa17.01■□□□□ 0.31
CHTF18-212ENST00000493715 COPRSQ9NQ92 184 aa17.01■□□□□ 0.31
CHTF18-212ENST00000493715 MAST3O60307 1309 aa17■□□□□ 0.31
CHTF18-212ENST00000493715 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
CHTF18-212ENST00000493715 FCGRTP55899 365 aa17■□□□□ 0.31
CHTF18-212ENST00000493715 ATP2B3Q16720 1220 aa17■□□□□ 0.31
CHTF18-212ENST00000493715 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa17■□□□□ 0.31
CHTF18-212ENST00000493715 SLAIN1Q8ND83 568 aa17■□□□□ 0.31
CHTF18-212ENST00000493715 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CHTF18-212ENST00000493715 ZDHHC15Q96MV8 337 aa17■□□□□ 0.31
CHTF18-212ENST00000493715 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
CHTF18-212ENST00000493715 CEP126Q9P2H0 1117 aa17■□□□□ 0.31
CHTF18-212ENST00000493715 ADGRA2Q96PE1 1338 aa16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-212ENST00000493715 SRGAP3O43295 1099 aa16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-212ENST00000493715 IL15P40933 162 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
CHTF18-212ENST00000493715 MTX1Q13505 466 aa16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.9 ms