RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 POU4F3Q15319 338 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-205ENST00000391970 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-205ENST00000391970 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-205ENST00000391970 MCF2L2Q86YR7 1114 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-205ENST00000391970 DTWD1Q8N5C7 304 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-205ENST00000391970 UBXN4Q92575 508 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-205ENST00000391970 SEC16BQ96JE7 1060 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-205ENST00000391970 CORO1BQ9BR76 489 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-205ENST00000391970 RRAGCQ9HB90 399 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-205ENST00000391970 ENAMQ9NRM1 1142 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-205ENST00000391970 KRT82Q9NSB4 513 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-205ENST00000391970 ROBO2Q9HCK4 1378 aa4.91□□□□□ -1.62
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PTPRC-205ENST00000391970 CILPO75339 1184 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 CTSBP07858 339 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 SOX9P48436 509 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 NLRP12P59046 1061 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 MPP2Q14168 576 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 TRAPPC3LQ5T215 181 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 LINC00114Q6XXX2 140 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 SLITRK4Q8IW52 837 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 FBXO27Q8NI29 283 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 DCAF11Q8TEB1 546 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 KCNB2Q92953 911 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 ARMC5Q96C12 935 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 TRIM11Q96F44 468 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 GINM1Q9NU53 330 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 A0A0A0MRY4 1105 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 TLR3O15455 904 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 SELPP16109 830 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 ATP2B1P20020 1258 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 CD68P34810 354 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 NASPP49321 788 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
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PTPRC-205ENST00000391970 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 REC114Q7Z4M0 266 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 FBXO11Q86XK2 927 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 GPBAR1Q8TDU6 330 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 NKD1Q969G9 470 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 USP26Q9BXU7 913 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 KCNK4Q9NYG8 393 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 EFR3BQ9Y2G0 817 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 DLL1O00548 723 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 GNB5O14775 395 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRC-205ENST00000391970 BPNT1O95861 308 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRC-205ENST00000391970 PDE3AQ14432 1141 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 SEZ6Q53EL9 994 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
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PTPRC-205ENST00000391970 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 ACSBG1Q96GR2 724 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 PLVAPQ9BX97 442 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 DLGAP3O95886 979 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 CDK8P49336 464 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 UBASH3BQ8TF42 649 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRC-205ENST00000391970 MKL2Q9ULH7 1088 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 STRIP2Q9ULQ0 834 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 PCDHA4Q9UN74 947 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 SPDYE3A6NKU9 549 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 PIK3R2O00459 728 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 WISP1O95388 367 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRC-205ENST00000391970 ZNF165P49910 485 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 LRFN4Q6PJG9 635 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 WDR18Q9BV38 432 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 BRMS1Q9HCU9 246 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 STK17AQ9UEE5 414 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 FAM229AH3BQW9 127 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 GFRA2O00451 464 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 AOC2O75106 756 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-205ENST00000391970 STK10O94804 968 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
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