RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376495.4

OTUD1-201, Transcript of OTU deubiquitinase 1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene OTUD1, Length 2,933 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1-201ENST00000376495 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 ZBTB43O43298 467 aa21.89■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 PRKAB2O43741 272 aa21.89■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 SHC4Q6S5L8 630 aa21.89■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.89■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 ARMT1Q9H993 441 aa21.89■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.88■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.88■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 PDE8BO95263 885 aa21.88■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 CMA1P23946 247 aa21.88■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 SLC39A14Q15043 492 aa21.88■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.88■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 GLI3P10071 1580 aa21.88■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 FOXN1O15353 648 aa21.88■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.88■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 KCPQ6ZWJ8 1503 aa21.87■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 NEMFO60524 1076 aa21.87■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 NLRP12P59046 1061 aa21.87■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 DPF2Q92785 391 aa21.87■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 MBD4O95243 580 aa21.87■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 SERPINC1P01008 464 aa21.87■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 GUCY1A2P33402 732 aa21.87■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 TRIM29Q14134 588 aa21.87■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 FBXL16Q8N461 479 aa21.87■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.87■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 NAPBQ9H115 298 aa21.87■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 ZMYM6O95789 1325 aa21.87■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 NCAPHQ15003 741 aa21.86■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 SYT10Q6XYQ8 523 aa21.86■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.86■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 FANCCQ00597 558 aa21.86■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 LONRF3Q496Y0 759 aa21.86■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 NYAP1Q6ZVC0 841 aa21.86■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 CFAP100Q494V2 611 aa21.86■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 PDILTQ8N807 584 aa21.86■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.85■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 BTBD18B2RXH4 712 aa21.85■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 HOMER1Q86YM7 354 aa21.85■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 KIF18AQ8NI77 898 aa21.85■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 SLAIN2Q9P270 581 aa21.85■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 PRDM4Q9UKN5 801 aa21.85■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.85■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.85■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 TPM4P67936 248 aa21.85■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 ELF2Q15723 593 aa21.85■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.85■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.85■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 TJP1Q07157 1748 aa21.84■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 GSDMDP57764 484 aa21.84■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 GRIN1Q05586 938 aa21.84■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.84■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 TACC3Q9Y6A5 838 aa21.84■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 BTG4Q9NY30 223 aa21.84■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 SMIM22K7EJ46 135 aa21.83■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 UBASH3AP57075 661 aa21.83■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 CNNM3Q8NE01 707 aa21.83■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 LY9Q9HBG7 655 aa21.83■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 FBXO3Q9UK99 471 aa21.83■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.83■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 RASGRF1Q13972 1273 aa21.83■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 ZNF827Q17R98 1081 aa21.83■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.83■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.83■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 LRRN4CLQ8ND94 238 aa21.83■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 TMX1Q9H3N1 280 aa21.83■■□□□ 1.09
OTUD1-201ENST00000376495 ADAMTSL3P82987 1691 aa21.83■■□□□ 1.08
OTUD1-201ENST00000376495 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.83■■□□□ 1.08
OTUD1-201ENST00000376495 TMEM232C9JQI7 657 aa21.83■■□□□ 1.08
OTUD1-201ENST00000376495 CDKL5O76039 1030 aa21.83■■□□□ 1.08
OTUD1-201ENST00000376495 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
OTUD1-201ENST00000376495 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.83■■□□□ 1.08
OTUD1-201ENST00000376495 FANCLQ9NW38 375 aa21.83■■□□□ 1.08
OTUD1-201ENST00000376495 TDO2P48775 406 aa21.82■■□□□ 1.08
OTUD1-201ENST00000376495 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa21.82■■□□□ 1.08
OTUD1-201ENST00000376495 SPATA5Q8NB90 893 aa21.82■■□□□ 1.08
OTUD1-201ENST00000376495 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa21.82■■□□□ 1.08
OTUD1-201ENST00000376495 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa21.82■■□□□ 1.08
OTUD1-201ENST00000376495 BCAMP50895 628 aa21.82■■□□□ 1.08
OTUD1-201ENST00000376495 PTPAQ15257 358 aa21.82■■□□□ 1.08
OTUD1-201ENST00000376495 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
OTUD1-201ENST00000376495 PKD1L3Q7Z443 1732 aa21.82■■□□□ 1.08
OTUD1-201ENST00000376495 NR5A1Q13285 461 aa21.81■■□□□ 1.08
OTUD1-201ENST00000376495 UBE3CQ15386 1083 aa21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms