RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 BBOX1O75936 387 aa21.05■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 AKNAD1Q5T1N1 836 aa21.05■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.05■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.04■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 UFL1O94874 794 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 POTEAQ6S8J7 498 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 TMEM87AQ8NBN3 555 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 SENP2Q9HC62 589 aa21.04■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 GOLGA8BA8MQT2 603 aa21.03■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 ZBTB22O15209 634 aa21.03■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 ATP2B4P23634 1241 aa21.03■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 MFSD6Q6ZSS7 791 aa21.03■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 GAS2L3Q86XJ1 694 aa21.03■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.03■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.03■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 MAST2Q6P0Q8 1798 aa21.02■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 FIBPO43427 364 aa21.02■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 KDM4AO75164 1064 aa21.02■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 FOSBP53539 338 aa21.02■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 PPARAQ07869 468 aa21.02■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.02■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.02■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa21.02■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 STAG1Q8WVM7 1258 aa21.02■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 GGA1Q9UJY5 639 aa21.02■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.02■□□□□ 0.96
ACTB-201ENST00000331789 MINDY4BA8MYZ0 360 aa21.02■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 SMIM22K7EJ46 135 aa21.02■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 MBD3O95983 291 aa21.02■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.02■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 TMEM87BQ96K49 555 aa21.01■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.01■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 KRT23Q9C075 422 aa21.01■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 CNNM2Q9H8M5 875 aa21.01■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.01■□□□□ 0.953e-17■□□□□ 10.5
ACTB-201ENST00000331789 H3BQV1 296 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 MMP10P09238 476 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 IFFO2Q5TF58 517 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP21■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 MSL1Q68DK7 614 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 CHMP4CQ96CF2 233 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 TOMM22Q9NS69 142 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 TMEM63CQ9P1W3 806 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 POLLQ9UGP5 575 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 TPRNQ4KMQ1 711 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 TMEM67Q5HYA8 995 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 WDR66Q8TBY9 1149 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 LY9Q9HBG7 655 aa21■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 GRIK5Q16478 980 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 CD209Q9NNX6 404 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.99■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 RESTQ13127 1097 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 SRGNP10124 158 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 SP8Q8IXZ3 490 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.98■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.97■□□□□ 0.954e-22■□□□□ 8.8
ACTB-201ENST00000331789 RXRAP19793 462 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 CTR9Q6PD62 1173 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 KIF3AQ9Y496 699 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 LTBP1Q14766 1721 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 MYH2Q9UKX2 1941 aa20.97■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 C6orf229H3BNL8 230 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 KRT85P78386 507 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 APOA5Q6Q788 366 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 CPLX1O14810 134 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 IL1R1P14778 569 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 LIFRP42702 1097 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.96■□□□□ 0.958e-18■□□□□ 9.9
ACTB-201ENST00000331789 ZNF445P59923 1031 aa20.96■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
ACTB-201ENST00000331789 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.3 ms