RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171735.1

Nisch-221, Transcript of Nischarin, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 1,763 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tmem79Q9D709 391 aa19.93■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tgm5Q9D7I9 724 aa19.93■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Hap1O35668 628 aa19.93■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Slc4a4O88343 1079 aa19.93■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Hspd1P63038 573 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rsph3aQ3UFY4 516 aa19.93■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tmed8Q3UHI4 326 aa19.93■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Lamc2Q61092 1191 aa19.93■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tbc1d23Q8K0F1 684 aa19.93■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tsc2Q61037 1814 aa19.92■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gnat2P50149 354 aa19.92■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Antxr1Q9CZ52 562 aa19.92■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Oog3Q3UWY1 500 aa19.91■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Kcnq3Q8K3F6 873 aa19.91■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ubxn2aQ99KJ0 258 aa19.91■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Myo1bP46735 1107 aa19.9■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 LeprP48356 1162 aa19.9■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cacnb3P54285 484 aa19.9■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rpusd2Q149F1 553 aa19.9■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gxylt1Q3UHH8 404 aa19.9■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Myl6bQ8CI43 207 aa19.9■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rbm43Q99J64 343 aa19.9■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa19.9■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zkscan16A2ALW2 728 aa19.9■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Alx1Q8C8B0 326 aa19.9■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Lman1lQ8VCD3 505 aa19.9■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ces1dQ8VCT4 565 aa19.9■□□□□ 0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Lbhd1A0A087WPA0 259 aa19.89■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rfx1P48377 963 aa19.89■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mum1l1Q4VA55 681 aa19.89■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ubxn10Q8BG34 277 aa19.89■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Xrcc4Q924T3 326 aa19.89■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zbed3Q9D0L1 228 aa19.89■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 AfdnQ9QZQ1 1820 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Prss40A6H6T1 365 aa19.88■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Bnip3O55003 187 aa19.88■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 CnpP16330 420 aa19.88■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Lins1Q3U1D0 764 aa19.88■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tigd5Q499M4 642 aa19.88■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ifit2Q64112 472 aa19.88■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 RabggtaQ9JHK4 567 aa19.88■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Casq1O09165 405 aa19.88■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Lrrfip2Q91WK0 415 aa19.88■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cyp27a1Q9DBG1 533 aa19.88■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mlh1Q9JK91 760 aa19.88■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Sik3Q6P4S6 1311 aa19.87■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 DaxxO35613 739 aa19.87■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa19.87■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Kank4Q6P9J5 1016 aa19.87■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Borcs6Q9D6W8 360 aa19.87■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trpm7Q923J1 1863 aa19.87■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rad50P70388 1312 aa19.87■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Bcorl1A2AQH4 1781 aa19.86■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ces1aE9PYP1 563 aa19.86■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Irf6P97431 467 aa19.86■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 MlphQ91V27 590 aa19.86■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Prss51A0A286YDY8 319 aa19.85■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 NapbP28663 298 aa19.85■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 DaglaQ6WQJ1 1044 aa19.85■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Stac3Q8BZ71 360 aa19.85■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Sept14Q9DA97 430 aa19.85■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa19.85■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rbm8a2A0A0N4SUH6 174 aa19.85■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 DnttP09838 530 aa19.85■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Yipf1Q91VU1 306 aa19.85■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rbm8aQ9CWZ3 174 aa19.85■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rai14Q9EP71 979 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fzd9Q9R216 592 aa19.85■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ak2Q9WTP6 239 aa19.85■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Dennd3A2RT67 1274 aa19.84■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Flvcr1B2RXV4 560 aa19.84■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ms4a2P20490 235 aa19.84■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ehmt1Q5DW34 1296 aa19.84■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 GnptabQ69ZN6 1235 aa19.84■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa19.84■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 SisF8VQM5 1818 aa19.84■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 FAM186AQ9D9R9 1790 aa19.83■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Slc4a9E9PUP3 929 aa19.83■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Klhdc9Q3USL1 350 aa19.83■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 HelbQ6NVF4 1074 aa19.83■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Pramel6Q810Y9 485 aa19.83■□□□□ 0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Eef2P58252 858 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ctr9Q62018 1173 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Sez6lQ6P1D5 963 aa19.83■□□□□ 0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Jakmip1Q8BVL9 626 aa19.83■□□□□ 0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gbp7Q91Z40 638 aa19.83■□□□□ 0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ugt1a5B2RT14 529 aa19.82■□□□□ 0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Prpf38aQ4FK66 312 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Plxnb2B2RXS4 1842 aa19.81■□□□□ 0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Prl7a2O54831 253 aa19.81■□□□□ 0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Slc27a3O88561 667 aa19.81■□□□□ 0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Olfr118Q7TRJ6 321 aa19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 70.9 ms