Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.29■■■■■ 5
CnpP16330 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
CnpP16330 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
CnpP16330 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
CnpP16330 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
CnpP16330 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.34■■■■□ 3.89
CnpP16330 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
CnpP16330 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
CnpP16330 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CnpP16330 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CnpP16330 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
CnpP16330 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
CnpP16330 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
CnpP16330 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CnpP16330 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
CnpP16330 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CnpP16330 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CnpP16330 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
CnpP16330 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CnpP16330 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
CnpP16330 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CnpP16330 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CnpP16330 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
CnpP16330 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CnpP16330 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CnpP16330 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CnpP16330 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CnpP16330 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
CnpP16330 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CnpP16330 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CnpP16330 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CnpP16330 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CnpP16330 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
CnpP16330 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CnpP16330 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CnpP16330 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CnpP16330 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CnpP16330 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CnpP16330 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CnpP16330 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CnpP16330 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CnpP16330 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
CnpP16330 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CnpP16330 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CnpP16330 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CnpP16330 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CnpP16330 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
CnpP16330 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CnpP16330 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CnpP16330 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CnpP16330 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CnpP16330 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CnpP16330 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CnpP16330 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CnpP16330 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CnpP16330 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CnpP16330 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
CnpP16330 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CnpP16330 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CnpP16330 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CnpP16330 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CnpP16330 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
CnpP16330 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CnpP16330 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CnpP16330 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
CnpP16330 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CnpP16330 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CnpP16330 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CnpP16330 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CnpP16330 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CnpP16330 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CnpP16330 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CnpP16330 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CnpP16330 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CnpP16330 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CnpP16330 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CnpP16330 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CnpP16330 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CnpP16330 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CnpP16330 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CnpP16330 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CnpP16330 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CnpP16330 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CnpP16330 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CnpP16330 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CnpP16330 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CnpP16330 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CnpP16330 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CnpP16330 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CnpP16330 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CnpP16330 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CnpP16330 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CnpP16330 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CnpP16330 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CnpP16330 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CnpP16330 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CnpP16330 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CnpP16330 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CnpP16330 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CnpP16330 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms