RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580081.1

CLTC-212, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 4

Gene CLTC, Length 575 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-212ENST00000580081 DOK5Q9P104 306 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-212ENST00000580081 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.78□□□□□ -1.32
CLTC-212ENST00000580081 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.32
CLTC-212ENST00000580081 BMPR1BO00238 502 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 CXorf1O96002 111 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 IGHV3-11P01762 117 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 IL4P05112 153 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 STAG3L2P0CL84 134 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 STAG3L3P0CL85 134 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 KHDC3LQ587J8 217 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 PATE2Q6UY27 113 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 SSX7Q7RTT5 188 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 COMMD7Q86VX2 200 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 MARC2Q969Z3 335 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 RNF24Q9Y225 148 aa6.77□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 A0A1B0GUS0 222 aa6.76□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.76□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 RAB19A4D1S5 217 aa6.76□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.76□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 PPP5D1E7EU14 171 aa6.76□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 NDUFA4O00483 81 aa6.76□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 IFNA1P01562 189 aa6.76□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 C8orf88P0DMB2 117 aa6.76□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 PSMB3P49720 205 aa6.76□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 PPT1P50897 306 aa6.76□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 PMS2P11Q13670 270 aa6.76□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.76□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.76□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 PQLC2Q6ZP29 291 aa6.76□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.76□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.76□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.76□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 RABAC1Q9UI14 185 aa6.76□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 A0A1B0GV50 99 aa6.75□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 H3BRN7 92 aa6.75□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 TRBV12-3P01733 135 aa6.75□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.75□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 PROK1P58294 105 aa6.75□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.75□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 UQCC3Q6UW78 93 aa6.75□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.75□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.75□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.75□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 FAM210AQ96ND0 272 aa6.75□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 UHRF2Q96PU4 802 aa6.75□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 OR5B12Q96R08 314 aa6.75□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.75□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 MANBALQ9NQG1 85 aa6.75□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 TMEM167BQ9NRX6 74 aa6.75□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 RNF114Q9Y508 228 aa6.75□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 I3L521 148 aa6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 OR7C2O60412 319 aa6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 ZP3P21754 424 aa6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 GCHFRP30047 84 aa6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 CCL20P78556 96 aa6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 RPEL1Q2QD12 228 aa6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 MORN5Q5VZ52 161 aa6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 GPHB5Q86YW7 130 aa6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 IQCF2Q8IXL9 164 aa6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 METTL26Q96S19 204 aa6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 GNG13Q9P2W3 67 aa6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.74□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.73□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.73□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 ZNF98A6NK75 572 aa6.73□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 BCL2P10415 239 aa6.73□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 NPPCP23582 126 aa6.73□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 PEA15Q15121 130 aa6.73□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 GUK1Q16774 197 aa6.73□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 TOR2AQ5JU69 321 aa6.73□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.73□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.73□□□□□ -1.33
CLTC-212ENST00000580081 LCE3BQ5TA77 95 aa6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms