RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 BTF3L4Q96K17 158 aa13.15□□□□□ -0.3
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TOM1-216ENST00000492723 HIST3H2BBQ8N257 126 aa13.1□□□□□ -0.31
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TOM1-216ENST00000492723 S100A2P29034 98 aa13.09□□□□□ -0.31
TOM1-216ENST00000492723 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP13.09□□□□□ -0.31
TOM1-216ENST00000492723 C15orf32Q32M92 178 aa13.09□□□□□ -0.31
TOM1-216ENST00000492723 PRR27Q6MZM9 219 aa13.09□□□□□ -0.31
TOM1-216ENST00000492723 KLF12Q9Y4X4 402 aa13.09□□□□□ -0.31
TOM1-216ENST00000492723 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
TOM1-216ENST00000492723 SCGB2A1O75556 95 aa13.08□□□□□ -0.32
TOM1-216ENST00000492723 CTSGP08311 255 aa13.08□□□□□ -0.32
TOM1-216ENST00000492723 TCL1AP56279 114 aa13.08□□□□□ -0.32
TOM1-216ENST00000492723 RHOGP84095 191 aa13.08□□□□□ -0.32
TOM1-216ENST00000492723 PIFOQ8TCI5 191 aa13.08□□□□□ -0.32
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