RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 TMEM256Q8N2U0 113 aa5.8□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 FAM216BQ8N7L0 139 aa5.8□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.8□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 A8MWV9 139 aa5.8□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.8□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 PRR20EP86478 221 aa5.8□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 PRR20CP86479 221 aa5.8□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 PRR20DP86480 221 aa5.8□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 PRR20BP86481 221 aa5.8□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 PRR20AP86496 221 aa5.8□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 SPINK4O60575 86 aa5.8□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 TMEM50AO95807 157 aa5.8□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 ELANEP08246 267 aa5.8□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF56Q15929 161 aa5.8□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 A8MWP6 167 aa5.8□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa5.8□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.8□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 DCAF16Q9NXF7 216 aa5.8□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 DKK4Q9UBT3 224 aa5.8□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.79□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 A0A1W2PRS3 328 aa5.79□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 C15orf65H3BRN8 121 aa5.79□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 CTSBP07858 339 aa5.79□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 UTF1Q5T230 341 aa5.79□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 FAM219BQ5XKK7 198 aa5.79□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 VMO1Q7Z5L0 202 aa5.79□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa5.79□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 TMEM105Q8N8V8 129 aa5.79□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 NPBQ8NG41 125 aa5.79□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa5.79□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 ACYP1P07311 99 aa5.79□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 ATOH7Q8N100 152 aa5.79□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 SLC25A20O43772 301 aa5.79□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 CTAG1AP78358 180 aa5.79□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 PYY3Q5JQD4 70 aa5.79□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.79□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 ODF3Q96PU9 254 aa5.79□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 HILPDAQ9Y5L2 63 aa5.79□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa5.79□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 A0A0G2JMM0 328 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 A0A1B0GUS0 222 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 A0A1W2PPB8 328 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 KIR3DP1A8MWS1 328 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 NCR2O95944 276 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 CRYBA4P53673 196 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 TFF2Q03403 129 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 UBE2V1Q13404 147 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 PRSS47A8MTI9 375 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 IFITM1P13164 125 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 LINC01356Q8N9X3 169 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 HIGD1BQ9P298 99 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 FAM157AC9JC47 383 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 APOMO95445 188 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 NBL1P41271 181 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 PAX9P55771 341 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 PLAURQ03405 335 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF841Q6ZN19 808 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 C10orf142B7Z368 130 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 F8W1H4 67 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 K7ENP7 123 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 INSP01308 110 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 FAM104BQ5XKR9 115 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 RNF114Q9Y508 228 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 SCN5AQ14524 2016 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 A0A087X0K7 114 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 TRAV2A0A0B4J234 112 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 A0A1W2PPE3 182 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 CFAP161Q6P656 301 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 SIGMAR1Q99720 223 aa5.78□□□□□ -1.48
ALMS1-201ENST00000423048 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 CELA3AP09093 270 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 SRD5A1P18405 259 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 Q0VFX4 171 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 TPRX1Q8N7U7 411 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 PROK2Q9HC23 129 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 U3KQA8 63 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 K7EMT4 169 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 M0R2P5 195 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 TIMM23O14925 209 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 PSG1P11464 419 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 ATRAIDQ6UW56 229 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 NUP35Q8NFH5 326 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 DOCK3Q8IZD9 2030 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 PSPNO60542 156 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 LHBP01229 141 aa5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.1 ms