RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GAMTQ14353 236 aa17.04■□□□□ 0.32
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 CENPSQ8N2Z9 138 aa17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRTM2Q8N967 370 aa17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP17.04■□□□□ 0.32
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 NRN1Q9NPD7 142 aa17.02■□□□□ 0.32
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 SRRQ9GZT4 340 aa17■□□□□ 0.31
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 ALMS1Q8TCU4 4167 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WRBO00258 174 aa16.99■□□□□ 0.31
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR8G2PQ6IF36 304 aa16.99■□□□□ 0.31
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 LINC00052Q96N35 136 aa16.94■□□□□ 0.3
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa16.92■□□□□ 0.3
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 CFDP00746 253 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IFNA21P01568 189 aa16.91■□□□□ 0.3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C2CD4CQ8TF44 421 aa16.91■□□□□ 0.3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRSS46E5RG02 174 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR4E1P0C645 316 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HLA-DRB4P13762 266 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP16.9■□□□□ 0.3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AKR1C1Q04828 323 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C4orf46Q504U0 113 aa16.9■□□□□ 0.3
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