RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 CLPSP04118 112 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 BCL2P10415 239 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 CRYGAP11844 174 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 COX6A1P12074 109 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 DYNLT3P51808 116 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.13□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGEF10O15013 1369 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 TECPR2O15040 1411 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 HMSDA8MTL9 139 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 HMGN1P05114 100 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 P0C880 135 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 S100A11P31949 105 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 AAED1Q7RTV5 226 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB128Q7Z7B8 93 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 PRR15Q8IV56 129 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 PDZD9Q8IXQ8 264 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 PRADC1Q9BSG0 188 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 YIPF3Q9GZM5 350 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 POPDC3Q9HBV1 291 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 JPT1Q9UK76 154 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 SLIT2O94813 1529 aa3.12□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 H7BYZ3 331 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 NDUFB3O43676 98 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 GADD45GO95257 159 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 RHOGP84095 191 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 SS18Q15532 418 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 LCE1EQ5T753 118 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 Q6ZQT0 140 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 AQP3Q92482 292 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 OTORQ9NRC9 128 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 MED31Q9Y3C7 131 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 OBSL1O75147 1896 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 SDK2Q58EX2 2172 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 KIF24Q5T7B8 1368 aa3.11□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 RIC1Q4ADV7 1423 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 CEP164Q9UPV0 1460 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 ODAMA1E959 279 aa3.1□□□□□ -1.91
RABGGTB-209ENST00000473406 ARRDC5A6NEK1 342 aa3.1□□□□□ -1.91
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RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
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RABGGTB-209ENST00000473406 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
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RABGGTB-209ENST00000473406 SLC30A7Q8NEW0 376 aa3.09□□□□□ -1.91
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RABGGTB-209ENST00000473406 BCL9O00512 1426 aa3.09□□□□□ -1.92
RABGGTB-209ENST00000473406 CD109Q6YHK3 1445 aa3.09□□□□□ -1.92
RABGGTB-209ENST00000473406 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa3.09□□□□□ -1.92
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RABGGTB-209ENST00000473406 J3KT08 172 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-209ENST00000473406 OVOL1O14753 267 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-209ENST00000473406 CST7O76096 145 aa3.08□□□□□ -1.92
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RABGGTB-209ENST00000473406 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF345Q14585 488 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-209ENST00000473406 HCP5Q6MZN7 132 aa3.08□□□□□ -1.92
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4D11Q8NGI4 311 aa3.08□□□□□ -1.92
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