RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NRN1Q9NPD7 142 aa18.99■□□□□ 0.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D24Q9ULP9 559 aa18.99■□□□□ 0.63
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 X6R8D5 127 aa18.99■□□□□ 0.63
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR8G2PQ6IF36 304 aa18.93■□□□□ 0.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q6ZTC4 211 aa18.93■□□□□ 0.62
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRR20CP86479 221 aa18.92■□□□□ 0.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRR20DP86480 221 aa18.92■□□□□ 0.62
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XCL2Q9UBD3 114 aa18.92■□□□□ 0.62
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM128Q5BJH2 165 aa18.9■□□□□ 0.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa18.9■□□□□ 0.62
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PITX3O75364 302 aa18.89■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB11AP62491 216 aa18.89■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PYDC2Q56P42 97 aa18.89■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOMM5Q8N4H5 51 aa18.89■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRIM63Q969Q1 353 aa18.89■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAH6Q9C0G6 4158 aa18.89■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IAPPP10997 89 aa18.88■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VAMP1P23763 118 aa18.88■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LYZP61626 148 aa18.88■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CELA1Q9UNI1 258 aa18.88■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNRPGP15A8MWD9 76 aa18.87■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ID1P41134 155 aa18.87■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf194Q5T5A4 169 aa18.87■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00052Q96N35 136 aa18.87■□□□□ 0.61
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa18.86■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2F1Q13607 317 aa18.86■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRTM2Q8N967 370 aa18.86■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1R14BQ96C90 147 aa18.86■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MED6O75586 246 aa18.85■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGKV3-20P01619 116 aa18.85■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A6P12236 298 aa18.85■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C12orf74Q32Q52 190 aa18.85■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GDF5OSQ5U4N7 250 aa18.85■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRGV9Q99603 122 aa18.85■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PSMB3P49720 205 aa18.84■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEFB1P60022 68 aa18.84■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF767PQ75MW2 155 aa18.84■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COQ8AQ8NI60 647 aa18.84■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMED3Q9Y3Q3 217 aa18.84■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 V9GYH0 126 aa18.84■□□□□ 0.61
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa18.83■□□□□ 0.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FOXI2Q6ZQN5 318 aa18.83■□□□□ 0.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR8I2Q8N0Y5 310 aa18.83■□□□□ 0.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THAP8Q8NA92 274 aa18.83■□□□□ 0.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOCS3O14543 225 aa18.82■□□□□ 0.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPP30P78346 268 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
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