RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 IGLC1P0CG04 106 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 RPL11P62913 178 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 ETFRF1Q6IPR1 90 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 WFDC3Q8IUB2 231 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 OR1S2Q8NGQ3 325 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 IL17DQ8TAD2 202 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 SRRQ9GZT4 340 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 U3KQ87 197 aa12.39□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A1W2PS18 150 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 UBE2CO00762 179 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 CRYBB3P26998 211 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 OR10J1P30954 320 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF124Q15973 351 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 Q6ZWC4 215 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 KIR2DL5AQ8N109 375 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 STPG3Q8N7X2 389 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 NPIPB3Q92617 1050 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 MS4A6AQ9H2W1 248 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 MAP6D1Q9H9H5 199 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 RYR3Q15413 4870 aa12.38□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 INPP1P49441 399 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 DEFB135Q30KP9 77 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 CENPSQ8N2Z9 138 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 Q8WTZ3 238 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 ACY3Q96HD9 319 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa12.37□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 AGRNO00468 2067 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 STARD9Q9P2P6 4700 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 SPRY2O43597 315 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 SFT2D2O95562 160 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 PPP1R1AQ13522 171 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 LRTM2Q8N967 370 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 RABAC1Q9UI14 185 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 CSMD3Q7Z407 3707 aa12.36□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 TENM2Q9NT68 2774 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 TRAV2A0A0B4J234 112 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 PITX3O75364 302 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 IFNA4P05014 189 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 P2RY1P47900 373 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 BAK1Q16611 211 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 TRIQKQ629K1 86 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 GRAMD2BQ96HH9 432 aa12.35□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC25A6P12236 298 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 DEFB131AP59861 70 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 STXBP6Q8NFX7 210 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 RNF183Q96D59 192 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 TMED3Q9Y3Q3 217 aa12.34□□□□□ -0.43
SH3BP4-211ENST00000493436 LCE6AA0A183 80 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 NAP1L6A6NFF2 107 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 IL4P05112 153 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP12.33□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 HOXB5P09067 269 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 RD3LP0DJH9 198 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 IAPPP10997 89 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 LEMD1Q68G75 181 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM24BQ8N5W8 94 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 CSTL1Q9H114 145 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 U3KQE9 123 aa12.33□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A0J9YWU9 116 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM90A26D6RGX4 464 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 K7EQG2 157 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 MED6O75586 246 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 NDUFB6O95139 128 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 TOMM40O96008 361 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 LYG2Q86SG7 212 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 SLC35E1Q96K37 410 aa12.32□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 MPTX1A8MV57 137 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 PSG1P11464 419 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 RAB11AP62491 216 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 GAMTQ14353 236 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 GGNBP1Q5YKI7 109 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 C16orf54Q6UWD8 224 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 GLMPQ8WWB7 406 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 MAGT1Q9H0U3 335 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 NDUFA13Q9P0J0 144 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 FLVCR2Q9UPI3 526 aa12.31□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 C9orf170A2RU37 121 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 HELTA6NFD8 242 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 ZFP92A6NM28 416 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 CENPXA8MT69 81 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 SYNGR2O43760 224 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 OR51G1Q8NGK1 321 aa12.3□□□□□ -0.44
SH3BP4-211ENST00000493436 DCANP1Q8TF63 244 aa12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.4 ms