RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 NPBWR1P48145 328 aa15.49■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 DEFA1P59665 94 aa15.49■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 DEFA3P59666 94 aa15.49■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa15.49■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 TMEM190Q8WZ59 177 aa15.49■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF414Q96IQ9 312 aa15.49■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 SEC22CQ9BRL7 303 aa15.49■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 PALMDQ9NP74 551 aa15.49■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF320A2RRD8 509 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 TMEM213A2RRL7 107 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 GNG7O60262 68 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 IFNA10P01566 189 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 IL5P05113 134 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 ELLP55199 621 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 RELQ04864 619 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 NRARPQ7Z6K4 114 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 HAPLN4Q86UW8 402 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 OR4D5Q8NGN0 318 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 OR4X1Q8NH49 305 aa15.48■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 SYNGR2O43760 224 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 FOLR2P14207 255 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 SPNP16150 400 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 ID3Q02535 119 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 MLANAQ16655 118 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 OR2K2Q8NGT1 345 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 MRAPQ8TCY5 172 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 UFC1Q9Y3C8 167 aa15.47■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 LY86O95711 162 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 TMEM50AO95807 157 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 SLC25A4P12235 298 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 CBLN1P23435 193 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 OR10C1Q96KK4 312 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 PRR25Q96S07 402 aa15.46■□□□□ 0.07
CLDN3-201ENST00000395145 CLN5O75503 358 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 C8orf88P0DMB2 117 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 IAPPP10997 89 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 GP9P14770 177 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 EDN2P20800 178 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 TM4SF20Q53R12 229 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 ETFRF1Q6IPR1 90 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 TMEM116Q8NCL8 245 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 MARC2Q969Z3 335 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 MAGT1Q9H0U3 335 aa15.45■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 C15orf62A8K5M9 175 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 K7EMT4 169 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 LCN12Q6JVE5 192 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 PRSS54Q6PEW0 395 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 DYNLRB2Q8TF09 96 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 MARVELD1Q9BSK0 173 aa15.44■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 WRBO00258 174 aa15.43■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 PRAF2O60831 178 aa15.43■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 RPP30P78346 268 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 CD69Q07108 199 aa15.43■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 DEFB114Q30KQ6 69 aa15.43■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 UXS1Q8NBZ7 420 aa15.43■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 CACNG8Q8WXS5 425 aa15.43■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 CCSO14618 274 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 SCGB2A1O75556 95 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 IFNA4P05014 189 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP15.42■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 RAB11AP62491 216 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 ZNF600Q6ZNG1 722 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 SLC16A13Q7RTY0 426 aa15.42■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 SNRPGP15A8MWD9 76 aa15.41■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 IGKV1-17P01599 117 aa15.41■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 IGLC1P0CG04 106 aa15.41■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 RND2P52198 227 aa15.41■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 C20orf24Q9BUV8 137 aa15.41■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 MLXQ9UH92 298 aa15.41■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 IZUMO1RA6ND01 250 aa15.4■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 TOMM20LQ6UXN7 152 aa15.4■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 OR1S2Q8NGQ3 325 aa15.4■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 GSKIPQ9P0R6 139 aa15.4■□□□□ 0.06
CLDN3-201ENST00000395145 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN3-201ENST00000395145 YIF1AO95070 293 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN3-201ENST00000395145 NPIPB3Q92617 1050 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN3-201ENST00000395145 SMIM8Q96KF7 97 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN3-201ENST00000395145 RAB40CQ96S21 281 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN3-201ENST00000395145 ZFAND3Q9H8U3 227 aa15.39■□□□□ 0.05
CLDN3-201ENST00000395145 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
CLDN3-201ENST00000395145 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms