RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 OR4C46A6NHA9 309 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 FAM166AQ6J272 317 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 ZNF600Q6ZNG1 722 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 NEU1Q99519 415 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 RNF5Q99942 180 aa14.17□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 LDLRAD4O15165 306 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 PAX1P15863 534 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 ARTNQ5T4W7 220 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 TMEM42Q69YG0 159 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 TUBA4BQ9H853 241 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 TIMM23O14925 209 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 OR9G9P0C7N8 305 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 IL36BQ9NZH7 164 aa14.16□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
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NISCH-213ENST00000489895 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 TMEM190Q8WZ59 177 aa14.15□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 FAM74A4Q5TZK3 123 aa14.15□□□□□ -0.14
NISCH-213ENST00000489895 LHFPL1Q86WI0 220 aa14.15□□□□□ -0.14
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NISCH-213ENST00000489895 IGKV3-20P01619 116 aa14.15□□□□□ -0.14
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NISCH-213ENST00000489895 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa14.14□□□□□ -0.15
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NISCH-213ENST00000489895 EGR1P18146 543 aa14.14□□□□□ -0.15
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NISCH-213ENST00000489895 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
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NISCH-213ENST00000489895 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa14.13□□□□□ -0.15
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NISCH-213ENST00000489895 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa14.13□□□□□ -0.15
NISCH-213ENST00000489895 C12orf54Q6X4T0 127 aa14.13□□□□□ -0.15
NISCH-213ENST00000489895 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa14.13□□□□□ -0.15
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NISCH-213ENST00000489895 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP14.13□□□□□ -0.15
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NISCH-213ENST00000489895 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
NISCH-213ENST00000489895 A0A1B0GUT8 65 aa14.12□□□□□ -0.15
NISCH-213ENST00000489895 TMEM200BQ69YZ2 307 aa14.12□□□□□ -0.15
NISCH-213ENST00000489895 TRAV40A0A0B4J280 105 aa14.12□□□□□ -0.15
NISCH-213ENST00000489895 B4DSR2 109 aa14.12□□□□□ -0.15
NISCH-213ENST00000489895 M0R1W7 72 aa14.12□□□□□ -0.15
NISCH-213ENST00000489895 SPATA45Q537H7 98 aa14.12□□□□□ -0.15
NISCH-213ENST00000489895 DMRTA2Q96SC8 542 aa14.12□□□□□ -0.15
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NISCH-213ENST00000489895 SDF2L1Q9HCN8 221 aa14.11□□□□□ -0.15
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NISCH-213ENST00000489895 PLA2G2CQ5R387 149 aa14.11□□□□□ -0.15
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NISCH-213ENST00000489895 C9JCJ5 164 aa14.11□□□□□ -0.15
NISCH-213ENST00000489895 PSPNO60542 156 aa14.11□□□□□ -0.15
NISCH-213ENST00000489895 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
NISCH-213ENST00000489895 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
NISCH-213ENST00000489895 WDR83OSQ9Y284 106 aa14.11□□□□□ -0.15
NISCH-213ENST00000489895 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
NISCH-213ENST00000489895 A0A1W2PRE2 83 aa14.1□□□□□ -0.15
NISCH-213ENST00000489895 KIAA1644Q3SXP7 199 aa14.1□□□□□ -0.15
NISCH-213ENST00000489895 IGFL3Q6UXB1 125 aa14.1□□□□□ -0.15
NISCH-213ENST00000489895 CD177Q8N6Q3 437 aa14.1□□□□□ -0.15
NISCH-213ENST00000489895 ATP5G3P48201 142 aa14.1□□□□□ -0.15
NISCH-213ENST00000489895 DUX3Q96PT4 197 aa14.1□□□□□ -0.15
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