RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
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PDE4D-204ENST00000358923 MMP23AO75900 390 aa14.78□□□□□ -0.04
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF134P52741 427 aa14.78□□□□□ -0.04
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PDE4D-204ENST00000358923 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa14.77□□□□□ -0.04
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PDE4D-204ENST00000358923 RUNX1Q01196 453 aa14.76□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 LINC01551Q86U37 167 aa14.76□□□□□ -0.05
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PDE4D-204ENST00000358923 CDS2O95674 445 aa14.76□□□□□ -0.05
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PDE4D-204ENST00000358923 LYPD2Q6UXB3 125 aa14.76□□□□□ -0.05
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PDE4D-204ENST00000358923 IL19Q9UHD0 177 aa14.76□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 NUPR1O60356 82 aa14.76□□□□□ -0.05
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PDE4D-204ENST00000358923 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 RPL39P5Q59GN2 51 aa14.76□□□□□ -0.05
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PDE4D-204ENST00000358923 C17orf98A8MV24 154 aa14.74□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 PROP1O75360 226 aa14.74□□□□□ -0.05
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PDE4D-204ENST00000358923 TXN2Q99757 166 aa14.73□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa14.73□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 PLXNB1O43157 2135 aa14.73□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF320A2RRD8 509 aa14.73□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM41BQ5BJD5 291 aa14.73□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF787Q6DD87 383 aa14.73□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa14.73□□□□□ -0.05
PDE4D-204ENST00000358923 MOB1BQ7L9L4 216 aa14.73□□□□□ -0.05
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