RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 SBF2Q86WG5 1849 aa15.8■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 PTGDSP41222 190 aa15.79■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 PRELID3AQ96N28 172 aa15.79■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 A0A087WV48 116 aa15.79■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 WFDC3Q8IUB2 231 aa15.79■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 LEAP2Q969E1 77 aa15.79■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa15.79■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 RIPPLY3P57055 190 aa15.79■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 C10orf128Q5T292 105 aa15.79■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 LRTM2Q8N967 370 aa15.79■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 TAF1LQ8IZX4 1826 aa15.79■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa15.79■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa15.79■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 IZUMO1RA6ND01 250 aa15.79■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM90A27PA6NNH2 459 aa15.79■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 TNFSF13O75888 250 aa15.79■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 CX3CL1P78423 397 aa15.79■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC25A53Q5H9E4 307 aa15.79■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 C18orf12Q96KH6 178 aa15.78■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 J3QRE1 110 aa15.78■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 TYMSP04818 313 aa15.78■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM242Q9NWH2 141 aa15.78■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 KLK10O43240 276 aa15.78■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 TSPAN13O95857 204 aa15.78■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa15.78■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 PROB1E7EW31 1015 aa15.78■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 GAS1P54826 345 aa15.78■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 LINC00305Q7Z4B0 112 aa15.78■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 BEND2Q8NDZ0 799 aa15.78■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 WFDC1Q9HC57 220 aa15.78■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 CEP250Q9BV73 2442 aa15.78■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 A0A1B0GUT8 65 aa15.77■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 NDUFS8O00217 210 aa15.77■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 STAG3L3P0CL85 134 aa15.77■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 PRSS8Q16651 343 aa15.77■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 OR10J6PQ8NGY7 276 aa15.77■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 C16orf92Q96LL3 132 aa15.77■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa15.77■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 PEX7O00628 323 aa15.77■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 COX5BP10606 129 aa15.77■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa15.77■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 ITLN1Q8WWA0 313 aa15.77■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 GFI1Q99684 422 aa15.77■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 C2orf88Q9BSF0 95 aa15.77■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 MYOFQ9NZM1 2061 aa15.77■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 SCN4AP35499 1836 aa15.77■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 MPZP25189 248 aa15.77■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 PSG9Q00887 426 aa15.77■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 KLRB1Q12918 225 aa15.77■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 LINC00114Q6XXX2 140 aa15.77■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa15.77■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 CYTL1Q9NRR1 136 aa15.77■□□□□ 0.12
AMIGO1-202ENST00000369864 REG1AP05451 166 aa15.77■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 NBEAP1P0C6P0 100 aa15.77■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 IGFBP2P18065 325 aa15.77■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 DCAF10Q5QP82 559 aa15.77■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 C10orf126Q8N4M7 172 aa15.77■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 DLX6P56179 175 aa15.76■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 RELQ04864 619 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 C1orf194Q5T5A4 169 aa15.76■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 LINC00470Q9BZP3 86 aa15.76■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 FBLN5Q9UBX5 448 aa15.76■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 LINC00614P0C842 121 aa15.76■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 ID1P41134 155 aa15.76■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 PSMG4Q5JS54 123 aa15.76■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa15.76■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa15.76■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 C21orf140B9A014 251 aa15.75■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 NAPSAO96009 420 aa15.75■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 OTOFQ9HC10 1997 aa15.75■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 NPIPB6E9PJ23 425 aa15.75■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 MOSP00540 346 aa15.75■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 NUDT11Q96G61 164 aa15.75■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 IGKV3-11P04433 115 aa15.75■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 OR5P3Q8WZ94 311 aa15.75■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 CFHR5Q9BXR6 569 aa15.75■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 C17orf98A8MV24 154 aa15.75■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 HIGD1CA8MV81 97 aa15.75■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 PRR32B1ATL7 298 aa15.75■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM54Q969K7 222 aa15.75■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa15.74■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM214BQ7L5A3 538 aa15.74■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 SIGMAR1Q99720 223 aa15.74■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa15.74■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF441Q8N8Z8 693 aa15.74■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 OR4C13Q8NGP0 309 aa15.74■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 SRXN1Q9BYN0 137 aa15.74■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 MFAP4P55083 255 aa15.74■□□□□ 0.11
AMIGO1-202ENST00000369864 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.1 ms