Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYN0

SRXN1, Sulfiredoxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRXN1Q9BYN0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SRXN1Q9BYN0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SRXN1Q9BYN0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SRXN1Q9BYN0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SRXN1Q9BYN0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SRXN1Q9BYN0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SRXN1Q9BYN0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRXN1Q9BYN0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SRXN1Q9BYN0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRXN1Q9BYN0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRXN1Q9BYN0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRXN1Q9BYN0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRXN1Q9BYN0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
SRXN1Q9BYN0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRXN1Q9BYN0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRXN1Q9BYN0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SRXN1Q9BYN0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRXN1Q9BYN0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRXN1Q9BYN0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRXN1Q9BYN0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SRXN1Q9BYN0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRXN1Q9BYN0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SRXN1Q9BYN0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SRXN1Q9BYN0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SRXN1Q9BYN0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SRXN1Q9BYN0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SRXN1Q9BYN0 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SRXN1Q9BYN0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRXN1Q9BYN0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SRXN1Q9BYN0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SRXN1Q9BYN0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SRXN1Q9BYN0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRXN1Q9BYN0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SRXN1Q9BYN0 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRXN1Q9BYN0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SRXN1Q9BYN0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SRXN1Q9BYN0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SRXN1Q9BYN0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SRXN1Q9BYN0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SRXN1Q9BYN0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRXN1Q9BYN0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRXN1Q9BYN0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRXN1Q9BYN0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRXN1Q9BYN0 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRXN1Q9BYN0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRXN1Q9BYN0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRXN1Q9BYN0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRXN1Q9BYN0 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRXN1Q9BYN0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SRXN1Q9BYN0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRXN1Q9BYN0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRXN1Q9BYN0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRXN1Q9BYN0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRXN1Q9BYN0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRXN1Q9BYN0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRXN1Q9BYN0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRXN1Q9BYN0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SRXN1Q9BYN0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRXN1Q9BYN0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SRXN1Q9BYN0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SRXN1Q9BYN0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRXN1Q9BYN0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRXN1Q9BYN0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRXN1Q9BYN0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRXN1Q9BYN0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRXN1Q9BYN0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRXN1Q9BYN0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRXN1Q9BYN0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRXN1Q9BYN0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SRXN1Q9BYN0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRXN1Q9BYN0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRXN1Q9BYN0 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRXN1Q9BYN0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRXN1Q9BYN0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRXN1Q9BYN0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRXN1Q9BYN0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRXN1Q9BYN0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRXN1Q9BYN0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRXN1Q9BYN0 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRXN1Q9BYN0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRXN1Q9BYN0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRXN1Q9BYN0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRXN1Q9BYN0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRXN1Q9BYN0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRXN1Q9BYN0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRXN1Q9BYN0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRXN1Q9BYN0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SRXN1Q9BYN0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRXN1Q9BYN0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SRXN1Q9BYN0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SRXN1Q9BYN0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SRXN1Q9BYN0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRXN1Q9BYN0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRXN1Q9BYN0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRXN1Q9BYN0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRXN1Q9BYN0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRXN1Q9BYN0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRXN1Q9BYN0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SRXN1Q9BYN0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRXN1Q9BYN0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms