RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287820.10

PPARG-201, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPARG, Length 1,850 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARG-201ENST00000287820 CCDC160A6NGH7 325 aa6.5□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 CGB1A6NKQ9 187 aa6.5□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 TEX22C9J3V5 150 aa6.5□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 MPPED1O15442 326 aa6.5□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 S1PR2O95136 353 aa6.5□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 RAB3DO95716 219 aa6.5□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 IGHV3-11P01762 117 aa6.5□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 FGF2P09038 288 aa6.5□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 OR8U8P0C7N1 319 aa6.5□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.376e-7■■■■□ 23.6
PPARG-201ENST00000287820 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.5□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.5□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 REC114Q7Z4M0 266 aa6.5□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 USMG5Q96IX5 58 aa6.5□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.5□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 COMMD9Q9P000 198 aa6.5□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 HMX3A6NHT5 357 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 LINC01619G3V211 115 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 KRASP01116 189 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 CRYGCP07315 174 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 HLA-GP17693 338 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 S100GP29377 79 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 RAB25P57735 213 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 KRTAP10-11P60412 298 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 RND3P61587 244 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 KLK9Q2XQG4 91 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 TBC1D26Q86UD7 250 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 DCUN1D4Q92564 292 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 COA4Q9NYJ1 87 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 A0A087WW49 117 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 MARCH11A6NNE9 402 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 MYOD1P15172 320 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 OR2B8PP59922 312 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 ZNF45Q02386 682 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 MEF2DQ14814 521 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 TMEM140Q9NV12 185 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.49□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.48□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 IGKV1-39P01597 117 aa6.48□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 PRH1P02810 166 aa6.48□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 IGKV1D-39P04432 117 aa6.48□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 AKAIN1P0CW23 69 aa6.48□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 RPA2P15927 270 aa6.48□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 CTRB1P17538 263 aa6.48□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 PI3P19957 117 aa6.48□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 G6PCP35575 357 aa6.48□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 PIGPP57054 158 aa6.48□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 RHOGP84095 191 aa6.48□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.48□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 CTRB2Q6GPI1 263 aa6.48□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 NECAP1Q8NC96 275 aa6.48□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 SEC22AQ96IW7 307 aa6.48□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.48□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.48□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 GPR132Q9UNW8 380 aa6.48□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 FAM223BA6NKX1 122 aa6.47□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.47□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 DISC1C4P0D8 188 aa6.47□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 OVOL1O14753 267 aa6.47□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 PGAM2P15259 253 aa6.47□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 AREGP15514 252 aa6.47□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 PSMB6P28072 239 aa6.47□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 INSL3P51460 131 aa6.47□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 SLURP1P55000 103 aa6.47□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 ERVK-16P61578 105 aa6.47□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 ATP5G2Q06055 141 aa6.47□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.47□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.47□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 CCDC190Q86UF4 302 aa6.47□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.47□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.47□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.47□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 COMMD5Q9GZQ3 224 aa6.47□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.47□□□□□ -1.37
PPARG-201ENST00000287820 NDUFA13Q9P0J0 144 aa6.47□□□□□ -1.37
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