RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417504.5

PTPA-211, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, humanhuman

TSL 4

Gene PTPA, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPA-211ENST00000417504 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 DDB2Q92466 427 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 CFHR4Q92496 578 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 IL22RA2Q969J5 263 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 R3HDM4Q96D70 268 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 SSX3Q99909 188 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 OR51J1Q9H342 316 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 COL6A5A8TX70 2615 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 A0A0A6YYJ9 748 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 A0A0B4J293 547 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 C7orf66A4D0T2 115 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 MARCH11A6NNE9 402 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 VGLL3A8MV65 326 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 FAM25EA8MYX2 175 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 IFNA21P01568 189 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 IGKV1-16P04430 117 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 CD24P25063 80 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 DYNLT3P51808 116 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 HNF4GQ14541 408 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 AANATQ16613 207 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 LIN54Q6MZP7 749 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 SSX9Q7RTT3 188 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 SLC35G3Q8N808 338 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 OR5R1Q8NH85 324 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 GLYATL2Q8WU03 294 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 MITD1Q8WV92 249 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 SPIN2AQ99865 258 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 MED28Q9H204 178 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 C1RLQ9NZP8 487 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 A0A0B4J2A0 478 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 GOSR2O14653 212 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 NBR2O15453 112 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 SPDEFO95238 335 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 KRASP01116 189 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 HOXB5P09067 269 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 G6PCP35575 357 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 LY6EQ16553 131 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 FAM219AQ8IW50 185 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 AJUBAQ96IF1 538 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 TMEM56Q96MV1 263 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 TMEM140Q9NV12 185 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 TCF19Q9Y242 345 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 TNCP24821 2201 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 PLXNB1O43157 2135 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 C5orf51A6NDU8 294 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 CCSO14618 274 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 SLC25A17O43808 307 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 SNAPC5O75971 98 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 KBTBD11O94819 623 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 OR2F2O95006 317 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 CDS2O95674 445 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 IGHV4-59P01825 116 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 VDAC1P21796 283 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 LGALS7P47929 136 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 UBE2KP61086 200 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 ZNF585BQ52M93 769 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 PRR31Q5SQ13 230 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 OR4A47Q6IF82 309 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 Q6ZNX1 250 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 C16orf82Q7Z2V1 217 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 TMEM219Q86XT9 240 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPA-211ENST00000417504 LRTM2Q8N967 370 aa6.48□□□□□ -1.37
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