RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 SYT8Q8NBV8 401 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRM-211ENST00000580170 A1L4Q6 167 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM229AB2RXF0 380 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRM-211ENST00000580170 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRM-211ENST00000580170 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
PTPRM-211ENST00000580170 UCP3P55916 312 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRM-211ENST00000580170 CDCP2Q5VXM1 449 aa18.24■□□□□ 0.51
PTPRM-211ENST00000580170 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
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PTPRM-211ENST00000580170 ATG2BQ96BY7 2078 aa18.24■□□□□ 0.51
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PTPRM-211ENST00000580170 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRM-211ENST00000580170 SHISA5Q8N114 240 aa18.23■□□□□ 0.51
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PTPRM-211ENST00000580170 C17orf51A8MQB3 221 aa18.23■□□□□ 0.51
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PTPRM-211ENST00000580170 TCF19Q9Y242 345 aa18.22■□□□□ 0.51
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PTPRM-211ENST00000580170 FTH1P19P0C7X4 201 aa18.21■□□□□ 0.51
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PTPRM-211ENST00000580170 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 RPS20P60866 119 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 STPG3Q8N7X2 389 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
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PTPRM-211ENST00000580170 C19orf54Q5BKX5 351 aa18.19■□□□□ 0.5
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PTPRM-211ENST00000580170 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa18.19■□□□□ 0.5
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PTPRM-211ENST00000580170 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa18.19■□□□□ 0.5
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PTPRM-211ENST00000580170 ATRAIDQ6UW56 229 aa18.19■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 NDUFA2O43678 99 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 PPIAL4GP0DN37 164 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 WNT9BO14905 357 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa18.18■□□□□ 0.5
PTPRM-211ENST00000580170 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
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