RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C19orf73Q9NVV2 129 aa19.97■□□□□ 0.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa19.97■□□□□ 0.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNCP24821 2201 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A8MZ25 164 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCGNO76038 276 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC22A5O76082 557 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HLA-DQB1P01920 261 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD36P16671 472 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RHOGP84095 191 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MMD2Q8IY49 270 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPARTQ8N0X7 666 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPIN2AQ99865 258 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DAPK2Q9UIK4 370 aa19.96■□□□□ 0.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP19.96■□□□□ 0.79
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM223BA6NKX1 122 aa19.95■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TUSC2O75896 110 aa19.95■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CSN3P07498 182 aa19.95■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNIH2Q6PI25 160 aa19.95■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TPRA1Q86W33 373 aa19.95■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM223AQ8IWN6 122 aa19.95■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AKIP1Q9NQ31 210 aa19.95■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa19.95■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM235A6NFC5 223 aa19.94■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2A4O95047 310 aa19.94■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRH1P02810 166 aa19.94■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNG2P59768 71 aa19.94■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL30P62888 115 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP5G2Q06055 141 aa19.94■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2B11Q5JQS5 317 aa19.94■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FCGR1BQ92637 280 aa19.94■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSR3Q9UNL2 185 aa19.94■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LYL1P12980 280 aa19.93■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF45Q02386 682 aa19.93■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C10orf55Q5SWW7 151 aa19.93■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCN12Q6JVE5 192 aa19.93■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CITED4Q96RK1 184 aa19.93■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PEMTQ9UBM1 199 aa19.93■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP19.93■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa19.92■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa19.92■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLV2-14P01704 120 aa19.92■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGKV1-13P0DP09 117 aa19.92■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GTSCR1Q86UQ5 136 aa19.92■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q8N402 240 aa19.92■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC9CQ8N5M4 171 aa19.92■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LGALS14Q8TCE9 139 aa19.92■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR51E2Q9H255 320 aa19.92■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANXA10Q9UJ72 324 aa19.92■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BMPR1BO00238 502 aa19.91■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SSX5O60225 188 aa19.91■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SFXN4Q6P4A7 337 aa19.91■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A42Q86VD7 318 aa19.91■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa19.91■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NECAP1Q8NC96 275 aa19.91■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR4S2Q8NH73 311 aa19.91■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa19.91■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PALMDQ9NP74 551 aa19.91■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AIREO43918 545 aa19.9■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RHBDL2Q9NX52 303 aa19.9■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA2Q9UM82 520 aa19.9■□□□□ 0.78
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VSTM2AQ8TAG5 236 aa19.89■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2A7Q96R45 310 aa19.89■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q9H521 79 aa19.89■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TUBA4BQ9H853 241 aa19.89■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IZUMO1RA6ND01 250 aa19.88■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2J3O76001 311 aa19.88■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SDC2P34741 201 aa19.88■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR2K2Q8NGT1 345 aa19.88■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA25Q9BR10 227 aa19.88■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAS2R8Q9NYW2 309 aa19.88■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa19.88■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HMX3A6NHT5 357 aa19.87■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KBTBD11O94819 623 aa19.87■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP6V1G2O95670 118 aa19.87■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MECP2P51608 486 aaKnown RBP19.87■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MXD1Q05195 221 aa19.87■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C15orf32Q32M92 178 aa19.87■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM209BQ5JX69 171 aa19.87■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF66Q6ZN08 573 aa19.87■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MFSD4AQ8N468 514 aa19.87■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa19.87■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DPPA5A6NC42 116 aa19.86■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TEX22C9J3V5 150 aa19.86■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARPC4P59998 168 aa19.86■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HAGHQ16775 308 aa19.86■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ISOC1Q96CN7 298 aa19.86■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms