Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1U6

TRBV9, T-cell receptor beta variable 9 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV9A0A0B4J1U6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRBV9A0A0B4J1U6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRBV9A0A0B4J1U6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRBV9A0A0B4J1U6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRBV9A0A0B4J1U6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRBV9A0A0B4J1U6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRBV9A0A0B4J1U6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRBV9A0A0B4J1U6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRBV9A0A0B4J1U6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRBV9A0A0B4J1U6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRBV9A0A0B4J1U6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRBV9A0A0B4J1U6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRBV9A0A0B4J1U6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRBV9A0A0B4J1U6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRBV9A0A0B4J1U6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRBV9A0A0B4J1U6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRBV9A0A0B4J1U6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRBV9A0A0B4J1U6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRBV9A0A0B4J1U6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRBV9A0A0B4J1U6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRBV9A0A0B4J1U6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRBV9A0A0B4J1U6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRBV9A0A0B4J1U6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRBV9A0A0B4J1U6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRBV9A0A0B4J1U6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRBV9A0A0B4J1U6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV9A0A0B4J1U6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBV9A0A0B4J1U6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV9A0A0B4J1U6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV9A0A0B4J1U6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBV9A0A0B4J1U6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRBV9A0A0B4J1U6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBV9A0A0B4J1U6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBV9A0A0B4J1U6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBV9A0A0B4J1U6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRBV9A0A0B4J1U6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRBV9A0A0B4J1U6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBV9A0A0B4J1U6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRBV9A0A0B4J1U6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRBV9A0A0B4J1U6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRBV9A0A0B4J1U6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRBV9A0A0B4J1U6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRBV9A0A0B4J1U6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBV9A0A0B4J1U6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV9A0A0B4J1U6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBV9A0A0B4J1U6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRBV9A0A0B4J1U6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBV9A0A0B4J1U6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRBV9A0A0B4J1U6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRBV9A0A0B4J1U6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRBV9A0A0B4J1U6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRBV9A0A0B4J1U6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRBV9A0A0B4J1U6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRBV9A0A0B4J1U6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRBV9A0A0B4J1U6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRBV9A0A0B4J1U6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRBV9A0A0B4J1U6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRBV9A0A0B4J1U6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRBV9A0A0B4J1U6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRBV9A0A0B4J1U6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRBV9A0A0B4J1U6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRBV9A0A0B4J1U6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRBV9A0A0B4J1U6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRBV9A0A0B4J1U6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRBV9A0A0B4J1U6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRBV9A0A0B4J1U6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRBV9A0A0B4J1U6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRBV9A0A0B4J1U6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRBV9A0A0B4J1U6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRBV9A0A0B4J1U6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRBV9A0A0B4J1U6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRBV9A0A0B4J1U6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRBV9A0A0B4J1U6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRBV9A0A0B4J1U6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRBV9A0A0B4J1U6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRBV9A0A0B4J1U6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRBV9A0A0B4J1U6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRBV9A0A0B4J1U6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRBV9A0A0B4J1U6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV9A0A0B4J1U6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV9A0A0B4J1U6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV9A0A0B4J1U6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRBV9A0A0B4J1U6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRBV9A0A0B4J1U6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRBV9A0A0B4J1U6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV9A0A0B4J1U6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV9A0A0B4J1U6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRBV9A0A0B4J1U6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV9A0A0B4J1U6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRBV9A0A0B4J1U6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRBV9A0A0B4J1U6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRBV9A0A0B4J1U6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRBV9A0A0B4J1U6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRBV9A0A0B4J1U6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRBV9A0A0B4J1U6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRBV9A0A0B4J1U6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRBV9A0A0B4J1U6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRBV9A0A0B4J1U6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRBV9A0A0B4J1U6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRBV9A0A0B4J1U6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
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